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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 44 | 72 | 22 | 6 | 16 | 68 | 50 | 18 |
| 2 | 横浜F | 44 | 69 | 19 | 12 | 13 | 54 | 45 | 9 |
| 3 | 千葉 | 44 | 68 | 18 | 14 | 12 | 62 | 45 | 17 |
| 4 | 栃木 | 44 | 68 | 19 | 11 | 14 | 56 | 49 | 7 |
| 5 | 松本 | 44 | 65 | 17 | 14 | 13 | 55 | 46 | 9 |
| 6 | 岡山 | 44 | 64 | 15 | 19 | 10 | 49 | 40 | 9 |
| 7 | 北九州 | 44 | 61 | 17 | 10 | 17 | 58 | 53 | 5 |
| 8 | 東京V | 44 | 60 | 15 | 15 | 14 | 56 | 47 | 9 |
| 9 | 徳島 | 44 | 58 | 16 | 10 | 18 | 56 | 58 | -2 |
| 10 | 熊本 | 44 | 58 | 16 | 10 | 18 | 50 | 59 | -9 |
| 11 | 甲府 | 24 | 56 | 16 | 8 | 0 | 40 | 19 | 21 |
| 12 | 水戸 | 44 | 55 | 14 | 13 | 17 | 51 | 56 | -5 |
| 13 | 山形 | 44 | 54 | 14 | 12 | 18 | 60 | 57 | 3 |
| 14 | 福岡 | 44 | 47 | 11 | 14 | 19 | 50 | 65 | -15 |
| 15 | 愛媛 | 44 | 46 | 12 | 10 | 22 | 43 | 57 | -14 |
| 16 | 群馬 | 44 | 44 | 10 | 14 | 20 | 34 | 55 | -21 |
| 17 | 富山 | 44 | 44 | 11 | 11 | 22 | 41 | 64 | -23 |
| 18 | G大阪 | 20 | 43 | 12 | 7 | 1 | 38 | 16 | 22 |
| 19 | 鳥取 | 44 | 43 | 11 | 10 | 23 | 37 | 71 | -34 |
| 20 | 湘南 | 24 | 42 | 11 | 9 | 4 | 35 | 21 | 14 |
| 21 | 神戸 | 20 | 41 | 12 | 5 | 3 | 36 | 20 | 16 |
| 22 | 大分 | 24 | 40 | 12 | 4 | 8 | 33 | 22 | 11 |
| 23 | 岐阜 | 44 | 36 | 7 | 15 | 22 | 31 | 67 | -36 |
| 24 | 長崎 | 20 | 35 | 10 | 5 | 5 | 24 | 20 | 4 |
| 25 | 札幌 | 20 | 29 | 9 | 2 | 9 | 24 | 21 | 3 |
| 26 | 町田 | 24 | 20 | 4 | 8 | 12 | 20 | 38 | -18 |
