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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 湘南 | 35 | 80 | 24 | 8 | 3 | 65 | 22 | 43 |
| 2 | 磐田 | 44 | 76 | 21 | 13 | 10 | 69 | 52 | 17 |
| 3 | 千葉 | 44 | 75 | 20 | 15 | 9 | 60 | 40 | 20 |
| 4 | 松本 | 35 | 70 | 20 | 10 | 5 | 53 | 28 | 25 |
| 5 | 岡山 | 44 | 68 | 17 | 17 | 10 | 59 | 47 | 12 |
| 6 | 北九州 | 44 | 64 | 18 | 10 | 16 | 51 | 52 | -1 |
| 7 | 札幌 | 44 | 63 | 16 | 15 | 13 | 50 | 46 | 4 |
| 8 | 横浜F | 44 | 60 | 15 | 15 | 14 | 56 | 53 | 3 |
| 9 | 大分 | 44 | 59 | 16 | 11 | 17 | 56 | 63 | -7 |
| 10 | 京都 | 44 | 58 | 14 | 16 | 14 | 56 | 60 | -4 |
| 11 | 山形 | 35 | 55 | 16 | 7 | 12 | 48 | 37 | 11 |
| 12 | 長崎 | 44 | 55 | 13 | 16 | 15 | 42 | 40 | 2 |
| 13 | 愛媛 | 44 | 55 | 15 | 10 | 19 | 56 | 60 | -4 |
| 14 | 福岡 | 44 | 53 | 14 | 11 | 19 | 53 | 60 | -7 |
| 15 | 東京V | 44 | 53 | 12 | 17 | 15 | 37 | 46 | -9 |
| 16 | 栃木 | 44 | 52 | 14 | 10 | 20 | 52 | 67 | -15 |
| 17 | 熊本 | 44 | 50 | 11 | 17 | 16 | 41 | 56 | -15 |
| 18 | 水戸 | 44 | 48 | 11 | 15 | 18 | 47 | 50 | -3 |
| 19 | 群馬 | 44 | 48 | 13 | 9 | 22 | 47 | 56 | -9 |
| 20 | 岐阜 | 44 | 43 | 11 | 10 | 23 | 51 | 73 | -22 |
| 21 | 讃岐 | 44 | 42 | 9 | 15 | 20 | 35 | 59 | -24 |
| 22 | 富山 | 35 | 22 | 5 | 7 | 23 | 26 | 58 | -32 |
| 23 | 金沢 | 9 | 21 | 7 | 0 | 2 | 16 | 5 | 11 |
| 24 | 大宮 | 9 | 17 | 5 | 2 | 2 | 12 | 8 | 4 |
| 25 | C大阪 | 9 | 15 | 4 | 3 | 2 | 17 | 12 | 5 |
| 26 | 徳島 | 9 | 9 | 2 | 3 | 4 | 7 | 12 | -5 |
