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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 磐田 | 60 | 103 | 28 | 19 | 13 | 97 | 71 | 26 |
| 2 | 福岡 | 60 | 99 | 28 | 15 | 17 | 82 | 65 | 17 |
| 3 | 千葉 | 60 | 88 | 23 | 19 | 18 | 74 | 62 | 12 |
| 4 | 大宮 | 42 | 86 | 26 | 8 | 8 | 72 | 37 | 35 |
| 5 | 北九州 | 60 | 86 | 25 | 11 | 24 | 84 | 83 | 1 |
| 6 | 長崎 | 60 | 83 | 21 | 20 | 19 | 61 | 50 | 11 |
| 7 | 愛媛 | 60 | 83 | 23 | 14 | 23 | 72 | 73 | -1 |
| 8 | 札幌 | 60 | 82 | 20 | 22 | 18 | 67 | 62 | 5 |
| 9 | 熊本 | 60 | 80 | 20 | 20 | 20 | 62 | 62 | 0 |
| 10 | 横浜F | 60 | 78 | 20 | 18 | 22 | 59 | 81 | -22 |
| 11 | 東京V | 60 | 77 | 20 | 17 | 23 | 57 | 60 | -3 |
| 12 | 京都 | 60 | 76 | 17 | 25 | 18 | 68 | 71 | -3 |
| 13 | 岡山 | 60 | 75 | 17 | 24 | 19 | 63 | 60 | 3 |
| 14 | 讃岐 | 60 | 72 | 17 | 21 | 22 | 46 | 56 | -10 |
| 15 | 群馬 | 60 | 70 | 19 | 13 | 28 | 57 | 80 | -23 |
| 16 | C大阪 | 42 | 67 | 18 | 13 | 11 | 57 | 40 | 17 |
| 17 | 大分 | 60 | 66 | 16 | 18 | 26 | 68 | 75 | -7 |
| 18 | 水戸 | 60 | 65 | 14 | 23 | 23 | 60 | 70 | -10 |
| 19 | 岐阜 | 60 | 63 | 17 | 12 | 31 | 58 | 96 | -38 |
| 20 | 栃木 | 60 | 58 | 13 | 19 | 28 | 63 | 92 | -29 |
| 21 | 金沢 | 42 | 54 | 12 | 18 | 12 | 46 | 43 | 3 |
| 22 | 徳島 | 42 | 53 | 13 | 14 | 15 | 35 | 44 | -9 |
| 23 | 湘南 | 18 | 34 | 9 | 7 | 2 | 33 | 15 | 18 |
| 24 | 松本 | 18 | 33 | 9 | 6 | 3 | 27 | 15 | 12 |
| 25 | 山形 | 18 | 33 | 10 | 3 | 5 | 29 | 21 | 8 |
| 26 | 富山 | 18 | 14 | 3 | 5 | 10 | 15 | 28 | -13 |
