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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 磐田 | 60 | 103 | 29 | 16 | 15 | 96 | 73 | 23 |
| 2 | 湘南 | 42 | 101 | 31 | 8 | 3 | 86 | 25 | 61 |
| 3 | 千葉 | 63 | 100 | 26 | 22 | 15 | 84 | 66 | 18 |
| 4 | 札幌 | 63 | 97 | 25 | 22 | 16 | 74 | 58 | 16 |
| 5 | 北九州 | 63 | 96 | 28 | 12 | 23 | 77 | 79 | -2 |
| 6 | 横浜F | 63 | 91 | 24 | 19 | 20 | 76 | 72 | 4 |
| 7 | 松本 | 45 | 89 | 26 | 11 | 8 | 69 | 38 | 31 |
| 8 | 福岡 | 63 | 86 | 23 | 17 | 23 | 80 | 83 | -3 |
| 9 | 岡山 | 63 | 84 | 20 | 24 | 19 | 69 | 67 | 2 |
| 10 | 長崎 | 63 | 83 | 21 | 20 | 22 | 70 | 60 | 10 |
| 11 | 栃木 | 63 | 81 | 21 | 18 | 24 | 77 | 85 | -8 |
| 12 | 京都 | 63 | 79 | 19 | 22 | 22 | 80 | 86 | -6 |
| 13 | 愛媛 | 63 | 76 | 20 | 16 | 27 | 78 | 83 | -5 |
| 14 | 大分 | 60 | 76 | 19 | 19 | 22 | 69 | 80 | -11 |
| 15 | 群馬 | 63 | 73 | 20 | 13 | 30 | 65 | 84 | -19 |
| 16 | 東京V | 63 | 71 | 16 | 23 | 24 | 52 | 68 | -16 |
| 17 | 水戸 | 63 | 70 | 17 | 19 | 27 | 64 | 73 | -9 |
| 18 | 熊本 | 63 | 70 | 16 | 22 | 25 | 59 | 85 | -26 |
| 19 | 山形 | 45 | 68 | 19 | 11 | 15 | 62 | 49 | 13 |
| 20 | 岐阜 | 63 | 68 | 18 | 14 | 31 | 75 | 102 | -27 |
| 21 | 讃岐 | 60 | 53 | 12 | 17 | 31 | 47 | 88 | -41 |
| 22 | 大宮 | 18 | 40 | 12 | 4 | 2 | 29 | 9 | 20 |
| 23 | 金沢 | 18 | 33 | 9 | 6 | 3 | 24 | 12 | 12 |
| 24 | C大阪 | 18 | 27 | 7 | 6 | 5 | 28 | 19 | 9 |
| 25 | 富山 | 45 | 26 | 6 | 8 | 31 | 32 | 78 | -46 |
| 26 | 徳島 | 21 | 23 | 4 | 11 | 6 | 18 | 22 | -4 |
| 27 | G大阪 | 3 | 7 | 2 | 1 | 0 | 6 | 3 | 3 |
| 28 | 神戸 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 5 | 3 | 2 |
| 29 | 鳥取 | 3 | 2 | 0 | 2 | 1 | 4 | 5 | -1 |
