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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 湘南 | 42 | 101 | 31 | 8 | 3 | 86 | 25 | 61 |
| 2 | 磐田 | 59 | 100 | 28 | 16 | 15 | 95 | 73 | 22 |
| 3 | 千葉 | 62 | 99 | 26 | 21 | 15 | 82 | 64 | 18 |
| 4 | 札幌 | 62 | 94 | 24 | 22 | 16 | 73 | 58 | 15 |
| 5 | 北九州 | 62 | 93 | 27 | 12 | 23 | 75 | 79 | -4 |
| 6 | 松本 | 45 | 89 | 26 | 11 | 8 | 69 | 38 | 31 |
| 7 | 横浜F | 62 | 88 | 23 | 19 | 20 | 74 | 71 | 3 |
| 8 | 福岡 | 62 | 85 | 23 | 16 | 23 | 78 | 81 | -3 |
| 9 | 長崎 | 62 | 83 | 21 | 20 | 21 | 70 | 59 | 11 |
| 10 | 岡山 | 62 | 83 | 20 | 23 | 19 | 68 | 66 | 2 |
| 11 | 栃木 | 62 | 81 | 21 | 18 | 23 | 77 | 83 | -6 |
| 12 | 京都 | 62 | 79 | 19 | 22 | 21 | 79 | 84 | -5 |
| 13 | 大分 | 59 | 75 | 19 | 18 | 22 | 68 | 79 | -11 |
| 14 | 愛媛 | 62 | 73 | 19 | 16 | 27 | 76 | 82 | -6 |
| 15 | 群馬 | 62 | 72 | 20 | 12 | 30 | 64 | 83 | -19 |
| 16 | 東京V | 62 | 71 | 16 | 23 | 23 | 51 | 66 | -15 |
| 17 | 熊本 | 62 | 70 | 16 | 22 | 24 | 59 | 83 | -24 |
| 18 | 水戸 | 62 | 69 | 17 | 18 | 27 | 63 | 72 | -9 |
| 19 | 山形 | 45 | 68 | 19 | 11 | 15 | 62 | 49 | 13 |
| 20 | 岐阜 | 62 | 68 | 18 | 14 | 30 | 75 | 101 | -26 |
| 21 | 讃岐 | 59 | 52 | 12 | 16 | 31 | 45 | 86 | -41 |
| 22 | 大宮 | 17 | 37 | 11 | 4 | 2 | 27 | 9 | 18 |
| 23 | 金沢 | 17 | 32 | 9 | 5 | 3 | 23 | 11 | 12 |
| 24 | C大阪 | 17 | 26 | 7 | 5 | 5 | 27 | 18 | 9 |
| 25 | 富山 | 45 | 26 | 6 | 8 | 31 | 32 | 78 | -46 |
| 26 | 徳島 | 20 | 22 | 4 | 10 | 6 | 16 | 20 | -4 |
| 27 | G大阪 | 3 | 7 | 2 | 1 | 0 | 6 | 3 | 3 |
| 28 | 神戸 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 5 | 3 | 2 |
| 29 | 鳥取 | 3 | 2 | 0 | 2 | 1 | 4 | 5 | -1 |
