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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 湘南 | 38 | 89 | 27 | 8 | 3 | 77 | 23 | 54 |
| 2 | 千葉 | 50 | 88 | 24 | 16 | 10 | 72 | 47 | 25 |
| 3 | 磐田 | 50 | 85 | 24 | 13 | 13 | 77 | 60 | 17 |
| 4 | 北九州 | 50 | 77 | 22 | 11 | 17 | 62 | 61 | 1 |
| 5 | 岡山 | 50 | 74 | 18 | 20 | 12 | 63 | 53 | 10 |
| 6 | 松本 | 38 | 73 | 21 | 10 | 7 | 56 | 34 | 22 |
| 7 | 札幌 | 50 | 72 | 18 | 18 | 14 | 56 | 49 | 7 |
| 8 | 福岡 | 50 | 68 | 19 | 11 | 20 | 64 | 67 | -3 |
| 9 | 長崎 | 50 | 66 | 16 | 18 | 16 | 58 | 48 | 10 |
| 10 | 大分 | 50 | 65 | 17 | 14 | 19 | 59 | 69 | -10 |
| 11 | 京都 | 50 | 64 | 15 | 19 | 16 | 63 | 68 | -5 |
| 12 | 横浜F | 50 | 63 | 16 | 15 | 19 | 58 | 61 | -3 |
| 13 | 山形 | 38 | 60 | 17 | 9 | 12 | 52 | 39 | 13 |
| 14 | 愛媛 | 50 | 60 | 16 | 12 | 22 | 62 | 66 | -4 |
| 15 | 栃木 | 50 | 60 | 16 | 12 | 22 | 57 | 73 | -16 |
| 16 | 熊本 | 50 | 58 | 13 | 19 | 18 | 48 | 66 | -18 |
| 17 | 群馬 | 50 | 57 | 16 | 9 | 25 | 52 | 63 | -11 |
| 18 | 東京V | 50 | 57 | 13 | 18 | 19 | 41 | 54 | -13 |
| 19 | 水戸 | 50 | 55 | 13 | 16 | 21 | 51 | 56 | -5 |
| 20 | 岐阜 | 50 | 51 | 13 | 12 | 25 | 56 | 78 | -22 |
| 21 | 讃岐 | 50 | 48 | 11 | 15 | 24 | 40 | 68 | -28 |
| 22 | 金沢 | 12 | 26 | 8 | 2 | 2 | 18 | 6 | 12 |
| 23 | 大宮 | 12 | 24 | 7 | 3 | 2 | 15 | 8 | 7 |
| 24 | 富山 | 38 | 22 | 5 | 7 | 26 | 26 | 67 | -41 |
| 25 | C大阪 | 12 | 18 | 5 | 3 | 4 | 21 | 15 | 6 |
| 26 | 徳島 | 12 | 12 | 2 | 6 | 4 | 8 | 13 | -5 |
