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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 湘南 | 42 | 101 | 31 | 8 | 3 | 86 | 25 | 61 |
| 2 | 千葉 | 56 | 93 | 25 | 18 | 13 | 78 | 57 | 21 |
| 3 | 松本 | 45 | 89 | 26 | 11 | 8 | 69 | 38 | 31 |
| 4 | 磐田 | 53 | 89 | 25 | 14 | 14 | 85 | 65 | 20 |
| 5 | 札幌 | 56 | 85 | 22 | 19 | 15 | 65 | 52 | 13 |
| 6 | 北九州 | 56 | 84 | 24 | 12 | 20 | 68 | 70 | -2 |
| 7 | 横浜F | 56 | 80 | 21 | 17 | 18 | 68 | 63 | 5 |
| 8 | 岡山 | 56 | 77 | 19 | 20 | 17 | 66 | 63 | 3 |
| 9 | 福岡 | 56 | 75 | 20 | 15 | 21 | 71 | 75 | -4 |
| 10 | 栃木 | 56 | 74 | 20 | 14 | 22 | 69 | 78 | -9 |
| 11 | 長崎 | 56 | 73 | 18 | 19 | 19 | 61 | 53 | 8 |
| 12 | 大分 | 53 | 71 | 19 | 14 | 20 | 63 | 72 | -9 |
| 13 | 京都 | 56 | 70 | 17 | 19 | 20 | 69 | 76 | -7 |
| 14 | 山形 | 45 | 68 | 19 | 11 | 15 | 62 | 49 | 13 |
| 15 | 水戸 | 56 | 67 | 17 | 16 | 23 | 58 | 61 | -3 |
| 16 | 愛媛 | 56 | 66 | 17 | 15 | 24 | 68 | 74 | -6 |
| 17 | 群馬 | 56 | 66 | 18 | 12 | 26 | 58 | 69 | -11 |
| 18 | 熊本 | 56 | 62 | 14 | 20 | 22 | 53 | 77 | -24 |
| 19 | 岐阜 | 56 | 60 | 16 | 12 | 28 | 67 | 89 | -22 |
| 20 | 東京V | 56 | 59 | 13 | 20 | 23 | 45 | 63 | -18 |
| 21 | 讃岐 | 53 | 45 | 10 | 15 | 28 | 40 | 80 | -40 |
| 22 | 富山 | 45 | 26 | 6 | 8 | 31 | 32 | 78 | -46 |
| 23 | 金沢 | 11 | 25 | 8 | 1 | 2 | 18 | 6 | 12 |
| 24 | 大宮 | 11 | 21 | 6 | 3 | 2 | 13 | 8 | 5 |
| 25 | C大阪 | 11 | 18 | 5 | 3 | 3 | 20 | 13 | 7 |
| 26 | 徳島 | 14 | 18 | 4 | 6 | 4 | 12 | 14 | -2 |
| 27 | G大阪 | 3 | 7 | 2 | 1 | 0 | 6 | 3 | 3 |
| 28 | 神戸 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 5 | 3 | 2 |
| 29 | 鳥取 | 3 | 2 | 0 | 2 | 1 | 4 | 5 | -1 |
