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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 48 | 96 | 28 | 12 | 8 | 74 | 47 | 27 |
| 2 | 湘南 | 40 | 95 | 29 | 8 | 3 | 79 | 22 | 57 |
| 3 | 北九州 | 48 | 76 | 21 | 13 | 14 | 59 | 58 | 1 |
| 4 | 千葉 | 48 | 73 | 19 | 16 | 13 | 65 | 54 | 11 |
| 5 | 山形 | 48 | 70 | 19 | 13 | 16 | 66 | 54 | 12 |
| 6 | 札幌 | 48 | 70 | 19 | 13 | 16 | 55 | 49 | 6 |
| 7 | 京都 | 48 | 69 | 17 | 18 | 13 | 66 | 60 | 6 |
| 8 | 磐田 | 40 | 66 | 18 | 12 | 10 | 66 | 52 | 14 |
| 9 | 横浜F | 48 | 66 | 17 | 15 | 16 | 59 | 52 | 7 |
| 10 | 栃木 | 48 | 66 | 18 | 12 | 18 | 66 | 69 | -3 |
| 11 | 岡山 | 48 | 65 | 16 | 17 | 15 | 57 | 58 | -1 |
| 12 | 長崎 | 48 | 62 | 15 | 17 | 16 | 53 | 46 | 7 |
| 13 | 福岡 | 48 | 61 | 16 | 13 | 19 | 60 | 65 | -5 |
| 14 | 水戸 | 48 | 60 | 14 | 18 | 16 | 55 | 53 | 2 |
| 15 | 大分 | 40 | 60 | 16 | 12 | 12 | 49 | 52 | -3 |
| 16 | 熊本 | 48 | 60 | 15 | 15 | 18 | 47 | 68 | -21 |
| 17 | 愛媛 | 48 | 55 | 13 | 16 | 19 | 61 | 64 | -3 |
| 18 | 群馬 | 48 | 54 | 15 | 9 | 24 | 55 | 65 | -10 |
| 19 | 岐阜 | 48 | 51 | 13 | 12 | 23 | 59 | 75 | -16 |
| 20 | 東京V | 48 | 46 | 10 | 16 | 22 | 35 | 59 | -24 |
| 21 | 富山 | 48 | 35 | 9 | 8 | 31 | 41 | 81 | -40 |
| 22 | 讃岐 | 40 | 33 | 7 | 12 | 21 | 34 | 69 | -35 |
| 23 | G大阪 | 8 | 16 | 5 | 1 | 2 | 20 | 10 | 10 |
| 24 | 神戸 | 8 | 12 | 3 | 3 | 2 | 16 | 7 | 9 |
| 25 | 徳島 | 8 | 11 | 3 | 2 | 3 | 7 | 9 | -2 |
| 26 | 鳥取 | 8 | 3 | 0 | 3 | 5 | 7 | 13 | -6 |
