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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 60 | 117 | 34 | 15 | 11 | 94 | 64 | 30 |
| 2 | 湘南 | 40 | 95 | 29 | 8 | 3 | 79 | 22 | 57 |
| 3 | 北九州 | 60 | 94 | 26 | 16 | 18 | 73 | 73 | 0 |
| 4 | 札幌 | 60 | 92 | 26 | 14 | 20 | 81 | 66 | 15 |
| 5 | 千葉 | 60 | 90 | 24 | 18 | 18 | 85 | 69 | 16 |
| 6 | 京都 | 60 | 88 | 22 | 22 | 16 | 83 | 75 | 8 |
| 7 | 山形 | 60 | 87 | 23 | 18 | 19 | 84 | 72 | 12 |
| 8 | 横浜F | 60 | 81 | 21 | 18 | 21 | 73 | 65 | 8 |
| 9 | 岡山 | 60 | 80 | 20 | 20 | 20 | 75 | 76 | -1 |
| 10 | 長崎 | 60 | 79 | 20 | 19 | 21 | 67 | 59 | 8 |
| 11 | 水戸 | 60 | 78 | 19 | 21 | 20 | 72 | 72 | 0 |
| 12 | 栃木 | 60 | 78 | 21 | 15 | 24 | 80 | 87 | -7 |
| 13 | 福岡 | 60 | 71 | 19 | 14 | 27 | 74 | 90 | -16 |
| 14 | 熊本 | 60 | 71 | 17 | 20 | 23 | 55 | 82 | -27 |
| 15 | 愛媛 | 60 | 67 | 16 | 19 | 25 | 70 | 77 | -7 |
| 16 | 磐田 | 40 | 66 | 18 | 12 | 10 | 66 | 52 | 14 |
| 17 | 群馬 | 60 | 66 | 18 | 12 | 30 | 66 | 80 | -14 |
| 18 | 東京V | 60 | 66 | 16 | 18 | 26 | 55 | 79 | -24 |
| 19 | 岐阜 | 60 | 65 | 17 | 14 | 29 | 70 | 94 | -24 |
| 20 | 大分 | 40 | 60 | 16 | 12 | 12 | 49 | 52 | -3 |
| 21 | 富山 | 60 | 46 | 11 | 13 | 36 | 53 | 97 | -44 |
| 22 | 神戸 | 20 | 39 | 12 | 3 | 5 | 40 | 19 | 21 |
| 23 | G大阪 | 20 | 38 | 11 | 5 | 4 | 51 | 28 | 23 |
| 24 | 徳島 | 20 | 38 | 11 | 5 | 4 | 29 | 18 | 11 |
| 25 | 讃岐 | 40 | 33 | 7 | 12 | 21 | 34 | 69 | -35 |
| 26 | 鳥取 | 20 | 9 | 0 | 9 | 11 | 17 | 38 | -21 |
