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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 66 | 114 | 34 | 12 | 20 | 104 | 71 | 33 |
| 2 | 松本 | 66 | 110 | 31 | 17 | 18 | 95 | 75 | 20 |
| 3 | 横浜F | 66 | 105 | 29 | 18 | 19 | 80 | 66 | 14 |
| 4 | 千葉 | 66 | 102 | 28 | 18 | 20 | 97 | 73 | 24 |
| 5 | 栃木 | 66 | 99 | 27 | 18 | 21 | 89 | 80 | 9 |
| 6 | 徳島 | 62 | 92 | 26 | 14 | 22 | 82 | 77 | 5 |
| 7 | 岡山 | 66 | 90 | 22 | 24 | 20 | 75 | 67 | 8 |
| 8 | 北九州 | 66 | 88 | 25 | 13 | 28 | 81 | 85 | -4 |
| 9 | G大阪 | 42 | 87 | 25 | 12 | 5 | 99 | 46 | 53 |
| 10 | 水戸 | 66 | 86 | 22 | 20 | 24 | 79 | 88 | -9 |
| 11 | 神戸 | 42 | 83 | 25 | 8 | 9 | 78 | 41 | 37 |
| 12 | 山形 | 66 | 83 | 21 | 20 | 25 | 98 | 93 | 5 |
| 13 | 東京V | 66 | 80 | 20 | 20 | 26 | 78 | 89 | -11 |
| 14 | 熊本 | 66 | 76 | 20 | 16 | 30 | 65 | 97 | -32 |
| 15 | 長崎 | 46 | 73 | 21 | 10 | 15 | 52 | 44 | 8 |
| 16 | 福岡 | 66 | 72 | 18 | 18 | 30 | 78 | 103 | -25 |
| 17 | 札幌 | 46 | 71 | 22 | 5 | 19 | 65 | 52 | 13 |
| 18 | 愛媛 | 66 | 71 | 17 | 20 | 29 | 63 | 79 | -16 |
| 19 | 群馬 | 66 | 69 | 17 | 18 | 31 | 62 | 89 | -27 |
| 20 | 富山 | 66 | 68 | 17 | 17 | 32 | 68 | 93 | -25 |
| 21 | 岐阜 | 66 | 60 | 14 | 18 | 34 | 62 | 113 | -51 |
| 22 | 鳥取 | 62 | 52 | 11 | 19 | 32 | 53 | 105 | -52 |
| 23 | 甲府 | 20 | 48 | 14 | 6 | 0 | 32 | 16 | 16 |
| 24 | 湘南 | 24 | 46 | 13 | 7 | 4 | 38 | 20 | 18 |
| 25 | 大分 | 24 | 37 | 11 | 4 | 9 | 32 | 24 | 8 |
| 26 | 町田 | 20 | 19 | 4 | 7 | 9 | 19 | 31 | -12 |
| 27 | 磐田 | 4 | 7 | 2 | 1 | 1 | 10 | 6 | 4 |
| 28 | 讃岐 | 4 | 0 | 0 | 0 | 4 | 2 | 13 | -11 |
