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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 60 | 117 | 34 | 15 | 11 | 94 | 63 | 31 |
| 2 | 北九州 | 60 | 94 | 26 | 16 | 18 | 74 | 71 | 3 |
| 3 | 千葉 | 60 | 93 | 25 | 18 | 17 | 86 | 68 | 18 |
| 4 | 湘南 | 39 | 92 | 28 | 8 | 3 | 75 | 22 | 53 |
| 5 | 札幌 | 60 | 91 | 26 | 13 | 21 | 80 | 66 | 14 |
| 6 | 京都 | 60 | 90 | 23 | 21 | 16 | 87 | 74 | 13 |
| 7 | 横浜F | 60 | 84 | 22 | 18 | 20 | 76 | 64 | 12 |
| 8 | 山形 | 60 | 84 | 22 | 18 | 20 | 84 | 74 | 10 |
| 9 | 長崎 | 60 | 81 | 21 | 18 | 21 | 69 | 60 | 9 |
| 10 | 岡山 | 60 | 80 | 20 | 20 | 20 | 74 | 76 | -2 |
| 11 | 水戸 | 60 | 75 | 18 | 21 | 21 | 69 | 72 | -3 |
| 12 | 栃木 | 60 | 75 | 20 | 15 | 25 | 78 | 90 | -12 |
| 13 | 福岡 | 60 | 74 | 20 | 14 | 26 | 74 | 88 | -14 |
| 14 | 熊本 | 60 | 69 | 16 | 21 | 23 | 53 | 82 | -29 |
| 15 | 愛媛 | 60 | 68 | 16 | 20 | 24 | 70 | 75 | -5 |
| 16 | 磐田 | 39 | 65 | 18 | 11 | 10 | 65 | 51 | 14 |
| 17 | 群馬 | 60 | 65 | 18 | 11 | 31 | 65 | 80 | -15 |
| 18 | 岐阜 | 60 | 65 | 17 | 14 | 29 | 72 | 99 | -27 |
| 19 | 東京V | 60 | 65 | 16 | 17 | 27 | 55 | 84 | -29 |
| 20 | 大分 | 39 | 60 | 16 | 12 | 11 | 47 | 49 | -2 |
| 21 | 富山 | 60 | 45 | 11 | 12 | 37 | 53 | 98 | -45 |
| 22 | G大阪 | 21 | 41 | 12 | 5 | 4 | 59 | 30 | 29 |
| 23 | 徳島 | 21 | 41 | 12 | 5 | 4 | 30 | 18 | 12 |
| 24 | 神戸 | 21 | 39 | 12 | 3 | 6 | 40 | 20 | 20 |
| 25 | 讃岐 | 39 | 32 | 7 | 11 | 21 | 33 | 68 | -35 |
| 26 | 鳥取 | 21 | 12 | 1 | 9 | 11 | 20 | 40 | -20 |
