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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 60 | 114 | 33 | 15 | 12 | 92 | 63 | 29 |
| 2 | 千葉 | 60 | 95 | 26 | 17 | 17 | 86 | 67 | 19 |
| 3 | 北九州 | 60 | 93 | 26 | 15 | 19 | 74 | 73 | 1 |
| 4 | 札幌 | 60 | 90 | 26 | 12 | 22 | 80 | 68 | 12 |
| 5 | 湘南 | 38 | 89 | 27 | 8 | 3 | 74 | 22 | 52 |
| 6 | 京都 | 60 | 88 | 22 | 22 | 16 | 86 | 74 | 12 |
| 7 | 横浜F | 60 | 86 | 23 | 17 | 20 | 75 | 62 | 13 |
| 8 | 山形 | 60 | 84 | 22 | 18 | 20 | 84 | 74 | 10 |
| 9 | 岡山 | 60 | 81 | 20 | 21 | 19 | 72 | 73 | -1 |
| 10 | 長崎 | 60 | 79 | 20 | 19 | 21 | 66 | 60 | 6 |
| 11 | 栃木 | 60 | 76 | 20 | 16 | 24 | 80 | 91 | -11 |
| 12 | 福岡 | 60 | 75 | 20 | 15 | 25 | 73 | 86 | -13 |
| 13 | 水戸 | 60 | 74 | 18 | 20 | 22 | 68 | 73 | -5 |
| 14 | 愛媛 | 60 | 71 | 17 | 20 | 23 | 71 | 72 | -1 |
| 15 | 熊本 | 60 | 69 | 16 | 21 | 23 | 53 | 81 | -28 |
| 16 | 群馬 | 60 | 68 | 19 | 11 | 30 | 67 | 79 | -12 |
| 17 | 岐阜 | 60 | 68 | 18 | 14 | 28 | 73 | 97 | -24 |
| 18 | 磐田 | 38 | 64 | 18 | 10 | 10 | 63 | 49 | 14 |
| 19 | 東京V | 60 | 64 | 16 | 16 | 28 | 56 | 86 | -30 |
| 20 | 大分 | 38 | 57 | 15 | 12 | 11 | 44 | 47 | -3 |
| 21 | G大阪 | 22 | 44 | 13 | 5 | 4 | 61 | 30 | 31 |
| 22 | 富山 | 60 | 43 | 10 | 13 | 37 | 52 | 98 | -46 |
| 23 | 神戸 | 22 | 42 | 13 | 3 | 6 | 42 | 21 | 21 |
| 24 | 徳島 | 22 | 41 | 12 | 5 | 5 | 30 | 20 | 10 |
| 25 | 讃岐 | 38 | 31 | 7 | 10 | 21 | 32 | 67 | -35 |
| 26 | 鳥取 | 22 | 12 | 1 | 9 | 12 | 20 | 41 | -21 |
