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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 60 | 109 | 32 | 13 | 15 | 90 | 68 | 22 |
| 2 | 京都 | 60 | 93 | 25 | 18 | 17 | 90 | 73 | 17 |
| 3 | 北九州 | 60 | 92 | 26 | 14 | 20 | 79 | 74 | 5 |
| 4 | 千葉 | 60 | 89 | 24 | 17 | 19 | 83 | 72 | 11 |
| 5 | 横浜F | 60 | 88 | 23 | 19 | 18 | 71 | 59 | 12 |
| 6 | 札幌 | 60 | 87 | 25 | 12 | 23 | 81 | 69 | 12 |
| 7 | 山形 | 60 | 85 | 22 | 19 | 19 | 89 | 74 | 15 |
| 8 | 岡山 | 60 | 85 | 21 | 22 | 17 | 72 | 66 | 6 |
| 9 | 湘南 | 32 | 83 | 26 | 5 | 1 | 68 | 16 | 52 |
| 10 | 福岡 | 60 | 81 | 22 | 15 | 23 | 76 | 83 | -7 |
| 11 | 長崎 | 60 | 80 | 21 | 17 | 22 | 67 | 62 | 5 |
| 12 | 栃木 | 60 | 79 | 21 | 16 | 23 | 86 | 91 | -5 |
| 13 | 水戸 | 60 | 75 | 19 | 18 | 23 | 65 | 73 | -8 |
| 14 | 岐阜 | 60 | 71 | 19 | 14 | 27 | 77 | 101 | -24 |
| 15 | 愛媛 | 60 | 66 | 16 | 18 | 26 | 72 | 78 | -6 |
| 16 | 熊本 | 60 | 65 | 15 | 20 | 25 | 57 | 97 | -40 |
| 17 | 群馬 | 60 | 64 | 17 | 13 | 30 | 66 | 84 | -18 |
| 18 | 東京V | 60 | 61 | 15 | 16 | 29 | 60 | 92 | -32 |
| 19 | G大阪 | 28 | 60 | 18 | 6 | 4 | 75 | 33 | 42 |
| 20 | 磐田 | 32 | 56 | 16 | 8 | 8 | 55 | 40 | 15 |
| 21 | 神戸 | 28 | 53 | 16 | 5 | 7 | 54 | 28 | 26 |
| 22 | 大分 | 32 | 49 | 13 | 10 | 9 | 38 | 41 | -3 |
| 23 | 徳島 | 28 | 48 | 14 | 6 | 8 | 38 | 29 | 9 |
| 24 | 富山 | 60 | 43 | 10 | 13 | 37 | 49 | 96 | -47 |
| 25 | 讃岐 | 32 | 24 | 5 | 9 | 18 | 28 | 59 | -31 |
| 26 | 鳥取 | 28 | 18 | 3 | 9 | 16 | 28 | 56 | -28 |
