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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 50 | 99 | 29 | 12 | 9 | 82 | 57 | 25 |
| 2 | 北九州 | 50 | 78 | 22 | 12 | 16 | 60 | 60 | 0 |
| 3 | 湘南 | 30 | 77 | 24 | 5 | 1 | 62 | 14 | 48 |
| 4 | 札幌 | 50 | 76 | 22 | 10 | 18 | 70 | 57 | 13 |
| 5 | 京都 | 50 | 74 | 19 | 17 | 14 | 71 | 64 | 7 |
| 6 | 千葉 | 50 | 72 | 19 | 15 | 16 | 69 | 58 | 11 |
| 7 | 横浜F | 50 | 72 | 19 | 15 | 16 | 59 | 49 | 10 |
| 8 | 岡山 | 50 | 71 | 18 | 17 | 15 | 62 | 58 | 4 |
| 9 | 山形 | 50 | 68 | 17 | 17 | 16 | 65 | 58 | 7 |
| 10 | 栃木 | 50 | 66 | 18 | 12 | 20 | 68 | 73 | -5 |
| 11 | 福岡 | 50 | 66 | 18 | 12 | 20 | 67 | 73 | -6 |
| 12 | 長崎 | 50 | 63 | 16 | 15 | 19 | 56 | 52 | 4 |
| 13 | 水戸 | 50 | 62 | 15 | 17 | 18 | 55 | 59 | -4 |
| 14 | 岐阜 | 50 | 60 | 16 | 12 | 22 | 63 | 76 | -13 |
| 15 | 熊本 | 50 | 56 | 13 | 17 | 20 | 43 | 71 | -28 |
| 16 | 愛媛 | 50 | 55 | 13 | 16 | 21 | 57 | 60 | -3 |
| 17 | 東京V | 50 | 55 | 14 | 13 | 23 | 49 | 72 | -23 |
| 18 | 磐田 | 30 | 52 | 15 | 7 | 8 | 51 | 38 | 13 |
| 19 | 群馬 | 50 | 52 | 14 | 10 | 26 | 54 | 71 | -17 |
| 20 | 大分 | 30 | 45 | 12 | 9 | 9 | 34 | 40 | -6 |
| 21 | 神戸 | 20 | 39 | 12 | 3 | 5 | 40 | 19 | 21 |
| 22 | G大阪 | 20 | 38 | 11 | 5 | 4 | 51 | 28 | 23 |
| 23 | 徳島 | 20 | 38 | 11 | 5 | 4 | 29 | 18 | 11 |
| 24 | 富山 | 50 | 34 | 8 | 10 | 32 | 42 | 84 | -42 |
| 25 | 讃岐 | 30 | 23 | 5 | 8 | 17 | 28 | 57 | -29 |
| 26 | 鳥取 | 20 | 9 | 0 | 9 | 11 | 17 | 38 | -21 |
