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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 51 | 102 | 30 | 12 | 9 | 84 | 57 | 27 |
| 2 | 北九州 | 51 | 78 | 22 | 12 | 17 | 61 | 62 | -1 |
| 3 | 湘南 | 30 | 77 | 24 | 5 | 1 | 62 | 14 | 48 |
| 4 | 京都 | 51 | 77 | 20 | 17 | 14 | 76 | 64 | 12 |
| 5 | 札幌 | 51 | 76 | 22 | 10 | 19 | 70 | 58 | 12 |
| 6 | 千葉 | 51 | 75 | 20 | 15 | 16 | 71 | 59 | 12 |
| 7 | 横浜F | 51 | 75 | 20 | 15 | 16 | 62 | 50 | 12 |
| 8 | 岡山 | 51 | 74 | 19 | 17 | 15 | 63 | 58 | 5 |
| 9 | 福岡 | 51 | 69 | 19 | 12 | 20 | 68 | 73 | -5 |
| 10 | 山形 | 51 | 68 | 17 | 17 | 17 | 67 | 61 | 6 |
| 11 | 長崎 | 51 | 66 | 17 | 15 | 19 | 58 | 53 | 5 |
| 12 | 栃木 | 51 | 66 | 18 | 12 | 21 | 69 | 76 | -7 |
| 13 | 水戸 | 51 | 62 | 15 | 17 | 19 | 55 | 61 | -6 |
| 14 | 岐阜 | 51 | 60 | 16 | 12 | 23 | 65 | 84 | -19 |
| 15 | 熊本 | 51 | 57 | 13 | 18 | 20 | 44 | 72 | -28 |
| 16 | 愛媛 | 51 | 56 | 13 | 17 | 21 | 58 | 61 | -3 |
| 17 | 東京V | 51 | 55 | 14 | 13 | 24 | 49 | 77 | -28 |
| 18 | 磐田 | 30 | 52 | 15 | 7 | 8 | 51 | 38 | 13 |
| 19 | 群馬 | 51 | 52 | 14 | 10 | 27 | 54 | 72 | -18 |
| 20 | 大分 | 30 | 45 | 12 | 9 | 9 | 34 | 40 | -6 |
| 21 | G大阪 | 21 | 41 | 12 | 5 | 4 | 59 | 30 | 29 |
| 22 | 徳島 | 21 | 41 | 12 | 5 | 4 | 30 | 18 | 12 |
| 23 | 神戸 | 21 | 39 | 12 | 3 | 6 | 40 | 20 | 20 |
| 24 | 富山 | 51 | 34 | 8 | 10 | 33 | 43 | 86 | -43 |
| 25 | 讃岐 | 30 | 23 | 5 | 8 | 17 | 28 | 57 | -29 |
| 26 | 鳥取 | 21 | 12 | 1 | 9 | 11 | 20 | 40 | -20 |
