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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 60 | 99 | 29 | 12 | 19 | 92 | 64 | 28 |
| 2 | 松本 | 60 | 99 | 28 | 15 | 17 | 81 | 69 | 12 |
| 3 | 千葉 | 60 | 92 | 25 | 17 | 18 | 91 | 68 | 23 |
| 4 | 横浜F | 60 | 92 | 25 | 17 | 18 | 73 | 63 | 10 |
| 5 | G大阪 | 42 | 87 | 25 | 12 | 5 | 99 | 46 | 53 |
| 6 | 徳島 | 57 | 84 | 24 | 12 | 21 | 75 | 71 | 4 |
| 7 | 神戸 | 42 | 83 | 25 | 8 | 9 | 78 | 41 | 37 |
| 8 | 岡山 | 60 | 83 | 20 | 23 | 17 | 72 | 62 | 10 |
| 9 | 栃木 | 60 | 83 | 22 | 17 | 21 | 80 | 79 | 1 |
| 10 | 北九州 | 60 | 83 | 24 | 11 | 25 | 77 | 78 | -1 |
| 11 | 水戸 | 60 | 80 | 21 | 17 | 22 | 71 | 80 | -9 |
| 12 | 山形 | 60 | 76 | 20 | 16 | 24 | 90 | 86 | 4 |
| 13 | 熊本 | 60 | 72 | 19 | 15 | 26 | 62 | 88 | -26 |
| 14 | 東京V | 60 | 71 | 17 | 20 | 23 | 70 | 81 | -11 |
| 15 | 長崎 | 45 | 70 | 20 | 10 | 15 | 50 | 43 | 7 |
| 16 | 札幌 | 45 | 68 | 21 | 5 | 19 | 62 | 52 | 10 |
| 17 | 福岡 | 60 | 68 | 17 | 17 | 26 | 68 | 87 | -19 |
| 18 | 愛媛 | 60 | 66 | 16 | 18 | 26 | 57 | 70 | -13 |
| 19 | 富山 | 60 | 65 | 17 | 14 | 29 | 63 | 85 | -22 |
| 20 | 群馬 | 60 | 62 | 15 | 17 | 28 | 56 | 81 | -25 |
| 21 | 岐阜 | 60 | 58 | 14 | 16 | 30 | 56 | 100 | -44 |
| 22 | 鳥取 | 57 | 49 | 10 | 19 | 28 | 50 | 96 | -46 |
| 23 | 湘南 | 18 | 35 | 10 | 5 | 3 | 29 | 15 | 14 |
| 24 | 甲府 | 15 | 33 | 9 | 6 | 0 | 23 | 13 | 10 |
| 25 | 大分 | 18 | 26 | 8 | 2 | 8 | 20 | 16 | 4 |
| 26 | 町田 | 15 | 17 | 4 | 5 | 6 | 16 | 25 | -9 |
| 27 | 磐田 | 3 | 6 | 2 | 0 | 1 | 7 | 3 | 4 |
| 28 | 讃岐 | 3 | 0 | 0 | 0 | 3 | 2 | 8 | -6 |
