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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 54 | 104 | 31 | 11 | 12 | 85 | 63 | 22 |
| 2 | 北九州 | 54 | 84 | 24 | 12 | 18 | 69 | 63 | 6 |
| 3 | 京都 | 54 | 83 | 22 | 17 | 15 | 82 | 66 | 16 |
| 4 | 千葉 | 54 | 82 | 22 | 16 | 16 | 75 | 61 | 14 |
| 5 | 横浜F | 54 | 82 | 22 | 16 | 16 | 67 | 53 | 14 |
| 6 | 札幌 | 54 | 79 | 23 | 10 | 21 | 75 | 62 | 13 |
| 7 | 湘南 | 29 | 76 | 24 | 4 | 1 | 61 | 13 | 48 |
| 8 | 岡山 | 54 | 76 | 19 | 19 | 16 | 64 | 60 | 4 |
| 9 | 山形 | 54 | 73 | 18 | 19 | 17 | 77 | 67 | 10 |
| 10 | 栃木 | 54 | 71 | 19 | 14 | 21 | 75 | 80 | -5 |
| 11 | 福岡 | 54 | 71 | 19 | 14 | 21 | 66 | 73 | -7 |
| 12 | 長崎 | 54 | 70 | 18 | 16 | 20 | 60 | 56 | 4 |
| 13 | 岐阜 | 54 | 68 | 19 | 11 | 24 | 74 | 93 | -19 |
| 14 | 水戸 | 54 | 66 | 16 | 18 | 20 | 57 | 65 | -8 |
| 15 | 愛媛 | 54 | 61 | 15 | 16 | 23 | 60 | 66 | -6 |
| 16 | 群馬 | 54 | 60 | 16 | 12 | 26 | 61 | 75 | -14 |
| 17 | 東京V | 54 | 57 | 14 | 15 | 25 | 54 | 83 | -29 |
| 18 | 熊本 | 54 | 54 | 12 | 18 | 24 | 47 | 87 | -40 |
| 19 | G大阪 | 25 | 51 | 15 | 6 | 4 | 65 | 31 | 34 |
| 20 | 磐田 | 29 | 51 | 15 | 6 | 8 | 50 | 37 | 13 |
| 21 | 神戸 | 25 | 47 | 14 | 5 | 6 | 48 | 25 | 23 |
| 22 | 徳島 | 25 | 45 | 13 | 6 | 6 | 35 | 24 | 11 |
| 23 | 大分 | 29 | 45 | 12 | 9 | 8 | 34 | 39 | -5 |
| 24 | 富山 | 54 | 35 | 8 | 11 | 35 | 44 | 89 | -45 |
| 25 | 讃岐 | 29 | 20 | 4 | 8 | 17 | 27 | 57 | -30 |
| 26 | 鳥取 | 25 | 12 | 1 | 9 | 15 | 26 | 50 | -24 |
