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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 50 | 98 | 29 | 11 | 10 | 80 | 56 | 24 |
| 2 | 北九州 | 50 | 77 | 22 | 11 | 17 | 58 | 59 | -1 |
| 3 | 京都 | 50 | 76 | 20 | 16 | 14 | 74 | 62 | 12 |
| 4 | 千葉 | 50 | 74 | 20 | 14 | 16 | 69 | 57 | 12 |
| 5 | 岡山 | 50 | 74 | 19 | 17 | 14 | 61 | 55 | 6 |
| 6 | 湘南 | 28 | 73 | 23 | 4 | 1 | 58 | 12 | 46 |
| 7 | 横浜F | 50 | 72 | 19 | 15 | 16 | 60 | 50 | 10 |
| 8 | 札幌 | 50 | 70 | 20 | 10 | 20 | 66 | 59 | 7 |
| 9 | 山形 | 50 | 68 | 17 | 17 | 16 | 68 | 59 | 9 |
| 10 | 福岡 | 50 | 67 | 18 | 13 | 19 | 63 | 68 | -5 |
| 11 | 長崎 | 50 | 64 | 16 | 16 | 18 | 55 | 51 | 4 |
| 12 | 栃木 | 50 | 63 | 17 | 12 | 21 | 65 | 73 | -8 |
| 13 | 水戸 | 50 | 62 | 15 | 17 | 18 | 56 | 62 | -6 |
| 14 | 岐阜 | 50 | 59 | 16 | 11 | 23 | 65 | 85 | -20 |
| 15 | 愛媛 | 50 | 58 | 14 | 16 | 20 | 55 | 56 | -1 |
| 16 | 群馬 | 50 | 55 | 15 | 10 | 25 | 55 | 68 | -13 |
| 17 | 東京V | 50 | 55 | 14 | 13 | 23 | 50 | 75 | -25 |
| 18 | 熊本 | 50 | 54 | 12 | 18 | 20 | 44 | 72 | -28 |
| 19 | 磐田 | 28 | 51 | 15 | 6 | 7 | 48 | 34 | 14 |
| 20 | G大阪 | 22 | 44 | 13 | 5 | 4 | 61 | 30 | 31 |
| 21 | 神戸 | 22 | 42 | 13 | 3 | 6 | 42 | 21 | 21 |
| 22 | 大分 | 28 | 42 | 11 | 9 | 8 | 32 | 38 | -6 |
| 23 | 徳島 | 22 | 41 | 12 | 5 | 5 | 30 | 20 | 10 |
| 24 | 富山 | 50 | 34 | 8 | 10 | 32 | 43 | 84 | -41 |
| 25 | 讃岐 | 28 | 17 | 3 | 8 | 17 | 25 | 56 | -31 |
| 26 | 鳥取 | 22 | 12 | 1 | 9 | 12 | 20 | 41 | -21 |
