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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 60 | 102 | 30 | 12 | 18 | 83 | 70 | 13 |
| 2 | 京都 | 60 | 98 | 28 | 14 | 18 | 94 | 70 | 24 |
| 3 | 長崎 | 60 | 92 | 25 | 17 | 18 | 71 | 57 | 14 |
| 4 | 千葉 | 60 | 90 | 24 | 18 | 18 | 87 | 72 | 15 |
| 5 | 栃木 | 60 | 89 | 24 | 17 | 19 | 84 | 76 | 8 |
| 6 | 札幌 | 60 | 88 | 26 | 10 | 24 | 82 | 69 | 13 |
| 7 | 山形 | 60 | 87 | 23 | 18 | 19 | 96 | 72 | 24 |
| 8 | 岡山 | 60 | 86 | 21 | 23 | 16 | 70 | 63 | 7 |
| 9 | G大阪 | 40 | 83 | 24 | 11 | 5 | 93 | 42 | 51 |
| 10 | 福岡 | 60 | 82 | 22 | 16 | 22 | 73 | 77 | -4 |
| 11 | 北九州 | 60 | 81 | 23 | 12 | 25 | 71 | 78 | -7 |
| 12 | 神戸 | 40 | 77 | 23 | 8 | 9 | 73 | 41 | 32 |
| 13 | 水戸 | 60 | 77 | 20 | 17 | 23 | 70 | 77 | -7 |
| 14 | 横浜F | 60 | 73 | 18 | 19 | 23 | 60 | 66 | -6 |
| 15 | 東京V | 60 | 71 | 17 | 20 | 23 | 64 | 82 | -18 |
| 16 | 熊本 | 60 | 67 | 15 | 22 | 23 | 60 | 93 | -33 |
| 17 | 徳島 | 40 | 66 | 20 | 6 | 14 | 54 | 48 | 6 |
| 18 | 愛媛 | 60 | 66 | 17 | 15 | 28 | 60 | 70 | -10 |
| 19 | 群馬 | 60 | 61 | 16 | 13 | 31 | 62 | 86 | -24 |
| 20 | 岐阜 | 60 | 59 | 15 | 14 | 31 | 62 | 105 | -43 |
| 21 | 湘南 | 20 | 57 | 19 | 0 | 1 | 48 | 9 | 39 |
| 22 | 富山 | 60 | 49 | 12 | 13 | 35 | 53 | 95 | -42 |
| 23 | 磐田 | 20 | 40 | 12 | 4 | 4 | 34 | 17 | 17 |
| 24 | 大分 | 20 | 30 | 8 | 6 | 6 | 19 | 24 | -5 |
| 25 | 鳥取 | 40 | 27 | 4 | 15 | 21 | 36 | 73 | -37 |
| 26 | 讃岐 | 20 | 10 | 2 | 4 | 14 | 12 | 39 | -27 |
