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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松本 | 36 | 70 | 21 | 7 | 8 | 56 | 43 | 13 |
| 2 | 北九州 | 36 | 60 | 18 | 6 | 12 | 43 | 40 | 3 |
| 3 | 湘南 | 20 | 57 | 19 | 0 | 1 | 48 | 9 | 39 |
| 4 | 栃木 | 36 | 57 | 16 | 9 | 11 | 54 | 47 | 7 |
| 5 | 京都 | 36 | 54 | 15 | 9 | 12 | 50 | 47 | 3 |
| 6 | 山形 | 36 | 53 | 13 | 14 | 9 | 51 | 38 | 13 |
| 7 | 札幌 | 36 | 53 | 15 | 8 | 13 | 48 | 42 | 6 |
| 8 | 岡山 | 36 | 51 | 13 | 12 | 11 | 43 | 41 | 2 |
| 9 | 福岡 | 36 | 48 | 13 | 9 | 14 | 49 | 54 | -5 |
| 10 | 長崎 | 36 | 47 | 12 | 11 | 13 | 43 | 36 | 7 |
| 11 | 千葉 | 36 | 46 | 12 | 10 | 14 | 47 | 48 | -1 |
| 12 | 横浜F | 36 | 46 | 12 | 10 | 14 | 39 | 40 | -1 |
| 13 | 水戸 | 36 | 44 | 11 | 11 | 14 | 43 | 49 | -6 |
| 14 | 群馬 | 36 | 43 | 12 | 7 | 17 | 43 | 48 | -5 |
| 15 | 愛媛 | 36 | 42 | 10 | 12 | 14 | 40 | 38 | 2 |
| 16 | 磐田 | 20 | 40 | 12 | 4 | 4 | 34 | 17 | 17 |
| 17 | 熊本 | 36 | 40 | 9 | 13 | 14 | 32 | 54 | -22 |
| 18 | 岐阜 | 36 | 38 | 10 | 8 | 18 | 41 | 59 | -18 |
| 19 | 東京V | 36 | 36 | 9 | 9 | 18 | 30 | 51 | -21 |
| 20 | G大阪 | 16 | 33 | 10 | 3 | 3 | 44 | 19 | 25 |
| 21 | 神戸 | 16 | 30 | 9 | 3 | 4 | 34 | 16 | 18 |
| 22 | 大分 | 20 | 30 | 8 | 6 | 6 | 19 | 24 | -5 |
| 23 | 富山 | 36 | 28 | 8 | 4 | 24 | 33 | 62 | -29 |
| 24 | 徳島 | 16 | 26 | 7 | 5 | 4 | 19 | 16 | 3 |
| 25 | 讃岐 | 20 | 10 | 2 | 4 | 14 | 12 | 39 | -27 |
| 26 | 鳥取 | 16 | 6 | 0 | 6 | 10 | 14 | 32 | -18 |
