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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 62 | 106 | 30 | 16 | 16 | 102 | 67 | 35 |
| 2 | 松本 | 62 | 101 | 29 | 14 | 19 | 88 | 76 | 12 |
| 3 | 千葉 | 62 | 96 | 26 | 18 | 18 | 96 | 77 | 19 |
| 4 | 横浜F | 62 | 90 | 24 | 18 | 20 | 73 | 66 | 7 |
| 5 | 栃木 | 62 | 90 | 25 | 15 | 22 | 85 | 79 | 6 |
| 6 | 岡山 | 62 | 88 | 22 | 22 | 18 | 72 | 63 | 9 |
| 7 | G大阪 | 42 | 87 | 25 | 12 | 5 | 99 | 46 | 53 |
| 8 | 長崎 | 53 | 85 | 24 | 13 | 16 | 66 | 51 | 15 |
| 9 | 神戸 | 42 | 83 | 25 | 8 | 9 | 78 | 41 | 37 |
| 10 | 北九州 | 62 | 83 | 24 | 11 | 27 | 77 | 83 | -6 |
| 11 | 水戸 | 62 | 80 | 20 | 20 | 22 | 68 | 78 | -10 |
| 12 | 札幌 | 53 | 79 | 24 | 7 | 22 | 69 | 58 | 11 |
| 13 | 山形 | 62 | 79 | 21 | 16 | 25 | 90 | 87 | 3 |
| 14 | 熊本 | 62 | 77 | 20 | 17 | 25 | 64 | 90 | -26 |
| 15 | 徳島 | 51 | 75 | 22 | 9 | 20 | 67 | 66 | 1 |
| 16 | 東京V | 62 | 74 | 18 | 20 | 24 | 73 | 84 | -11 |
| 17 | 福岡 | 62 | 74 | 19 | 17 | 26 | 70 | 87 | -17 |
| 18 | 愛媛 | 62 | 73 | 18 | 19 | 25 | 63 | 71 | -8 |
| 19 | 富山 | 62 | 62 | 16 | 14 | 32 | 61 | 94 | -33 |
| 20 | 岐阜 | 62 | 62 | 16 | 14 | 32 | 59 | 104 | -45 |
| 21 | 群馬 | 62 | 56 | 14 | 14 | 34 | 56 | 90 | -34 |
| 22 | 湘南 | 20 | 45 | 14 | 3 | 3 | 45 | 15 | 30 |
| 23 | 鳥取 | 51 | 42 | 8 | 18 | 25 | 46 | 87 | -41 |
| 24 | 大分 | 20 | 31 | 9 | 4 | 7 | 22 | 20 | 2 |
| 25 | 磐田 | 11 | 23 | 7 | 2 | 2 | 22 | 11 | 11 |
| 26 | 甲府 | 9 | 19 | 5 | 4 | 0 | 16 | 10 | 6 |
| 27 | 町田 | 9 | 9 | 2 | 3 | 4 | 11 | 17 | -6 |
| 28 | 讃岐 | 11 | 2 | 0 | 2 | 9 | 7 | 27 | -20 |
