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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 51 | 89 | 26 | 11 | 14 | 86 | 55 | 31 |
| 2 | G大阪 | 42 | 87 | 25 | 12 | 5 | 99 | 46 | 53 |
| 3 | 神戸 | 42 | 83 | 25 | 8 | 9 | 78 | 41 | 37 |
| 4 | 松本 | 51 | 83 | 24 | 11 | 16 | 71 | 63 | 8 |
| 5 | 千葉 | 51 | 81 | 22 | 15 | 14 | 83 | 58 | 25 |
| 6 | 横浜F | 51 | 78 | 21 | 15 | 15 | 62 | 52 | 10 |
| 7 | 徳島 | 50 | 75 | 22 | 9 | 19 | 66 | 64 | 2 |
| 8 | 栃木 | 51 | 73 | 20 | 13 | 18 | 73 | 70 | 3 |
| 9 | 岡山 | 51 | 71 | 17 | 20 | 14 | 61 | 53 | 8 |
| 10 | 長崎 | 43 | 69 | 20 | 9 | 14 | 50 | 40 | 10 |
| 11 | 札幌 | 43 | 67 | 21 | 4 | 18 | 61 | 49 | 12 |
| 12 | 東京V | 51 | 65 | 16 | 17 | 18 | 63 | 71 | -8 |
| 13 | 水戸 | 51 | 65 | 16 | 17 | 18 | 60 | 71 | -11 |
| 14 | 山形 | 51 | 64 | 17 | 13 | 21 | 77 | 75 | 2 |
| 15 | 愛媛 | 51 | 64 | 16 | 16 | 19 | 54 | 57 | -3 |
| 16 | 北九州 | 51 | 61 | 17 | 10 | 24 | 61 | 73 | -12 |
| 17 | 熊本 | 51 | 61 | 16 | 13 | 22 | 52 | 78 | -26 |
| 18 | 福岡 | 51 | 58 | 15 | 13 | 23 | 55 | 71 | -16 |
| 19 | 富山 | 51 | 55 | 14 | 13 | 24 | 54 | 71 | -17 |
| 20 | 群馬 | 51 | 47 | 11 | 14 | 26 | 48 | 75 | -27 |
| 21 | 岐阜 | 51 | 46 | 11 | 13 | 27 | 47 | 92 | -45 |
| 22 | 鳥取 | 50 | 41 | 8 | 17 | 25 | 45 | 86 | -41 |
| 23 | 甲府 | 8 | 18 | 5 | 3 | 0 | 15 | 9 | 6 |
| 24 | 湘南 | 9 | 15 | 4 | 3 | 2 | 13 | 8 | 5 |
| 25 | 大分 | 9 | 13 | 4 | 1 | 4 | 11 | 8 | 3 |
| 26 | 町田 | 8 | 8 | 2 | 2 | 4 | 10 | 16 | -6 |
| 27 | 磐田 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | -1 |
| 28 | 讃岐 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | -2 |
