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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 38 | 77 | 21 | 14 | 3 | 55 | 30 | 25 |
| 2 | 横浜F | 44 | 76 | 23 | 7 | 14 | 66 | 49 | 17 |
| 3 | 京都 | 44 | 76 | 23 | 7 | 14 | 65 | 49 | 16 |
| 4 | 千葉 | 44 | 74 | 21 | 11 | 12 | 67 | 35 | 32 |
| 5 | 岡山 | 44 | 73 | 19 | 16 | 9 | 45 | 32 | 13 |
| 6 | 東京V | 44 | 66 | 19 | 9 | 16 | 64 | 46 | 18 |
| 7 | 大分 | 38 | 65 | 19 | 8 | 11 | 51 | 34 | 17 |
| 8 | 北九州 | 44 | 65 | 19 | 8 | 17 | 57 | 56 | 1 |
| 9 | 松本 | 44 | 64 | 16 | 16 | 12 | 51 | 43 | 8 |
| 10 | 山形 | 44 | 64 | 17 | 13 | 14 | 57 | 51 | 6 |
| 11 | 栃木 | 44 | 64 | 18 | 10 | 16 | 54 | 48 | 6 |
| 12 | 湘南 | 38 | 63 | 16 | 15 | 7 | 56 | 39 | 17 |
| 13 | 熊本 | 44 | 58 | 15 | 13 | 16 | 44 | 52 | -8 |
| 14 | 徳島 | 44 | 54 | 14 | 12 | 18 | 48 | 54 | -6 |
| 15 | 水戸 | 44 | 53 | 13 | 14 | 17 | 46 | 54 | -8 |
| 16 | 愛媛 | 44 | 51 | 12 | 15 | 17 | 46 | 48 | -2 |
| 17 | 群馬 | 44 | 48 | 12 | 12 | 20 | 30 | 48 | -18 |
| 18 | 富山 | 44 | 46 | 12 | 10 | 22 | 41 | 57 | -16 |
| 19 | 鳥取 | 44 | 43 | 12 | 7 | 25 | 36 | 77 | -41 |
| 20 | 福岡 | 44 | 41 | 9 | 14 | 21 | 55 | 71 | -16 |
| 21 | 岐阜 | 44 | 35 | 7 | 14 | 23 | 24 | 58 | -34 |
| 22 | 町田 | 38 | 26 | 5 | 11 | 22 | 30 | 64 | -34 |
| 23 | 神戸 | 6 | 15 | 5 | 0 | 1 | 13 | 6 | 7 |
| 24 | G大阪 | 6 | 10 | 2 | 4 | 0 | 12 | 8 | 4 |
| 25 | 長崎 | 6 | 8 | 2 | 2 | 2 | 7 | 8 | -1 |
| 26 | 札幌 | 6 | 6 | 2 | 0 | 4 | 4 | 7 | -3 |
