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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 66 | 116 | 36 | 8 | 22 | 98 | 76 | 22 |
| 2 | 千葉 | 66 | 107 | 30 | 17 | 19 | 90 | 53 | 37 |
| 3 | 東京V | 66 | 100 | 28 | 16 | 22 | 102 | 71 | 31 |
| 4 | 横浜F | 66 | 98 | 29 | 11 | 26 | 90 | 87 | 3 |
| 5 | 岡山 | 66 | 97 | 25 | 22 | 19 | 62 | 60 | 2 |
| 6 | 湘南 | 60 | 96 | 26 | 18 | 16 | 93 | 68 | 25 |
| 7 | 大分 | 60 | 96 | 27 | 15 | 18 | 82 | 62 | 20 |
| 8 | 北九州 | 66 | 95 | 27 | 14 | 25 | 84 | 84 | 0 |
| 9 | 徳島 | 66 | 93 | 25 | 18 | 23 | 80 | 75 | 5 |
| 10 | 栃木 | 66 | 88 | 24 | 16 | 26 | 71 | 73 | -2 |
| 11 | 甲府 | 42 | 86 | 24 | 14 | 4 | 63 | 35 | 28 |
| 12 | 熊本 | 66 | 83 | 22 | 17 | 27 | 64 | 85 | -21 |
| 13 | 群馬 | 66 | 80 | 20 | 20 | 26 | 55 | 75 | -20 |
| 14 | 水戸 | 66 | 78 | 20 | 18 | 28 | 73 | 83 | -10 |
| 15 | 愛媛 | 66 | 76 | 17 | 25 | 24 | 74 | 80 | -6 |
| 16 | 富山 | 66 | 74 | 19 | 17 | 30 | 66 | 86 | -20 |
| 17 | 山形 | 48 | 73 | 20 | 13 | 15 | 64 | 57 | 7 |
| 18 | 松本 | 48 | 67 | 17 | 16 | 15 | 53 | 50 | 3 |
| 19 | 鳥取 | 66 | 61 | 17 | 10 | 39 | 58 | 118 | -60 |
| 20 | 岐阜 | 66 | 50 | 10 | 20 | 36 | 50 | 108 | -58 |
| 21 | 福岡 | 48 | 48 | 11 | 15 | 22 | 59 | 75 | -16 |
| 22 | 札幌 | 24 | 40 | 13 | 1 | 10 | 28 | 21 | 7 |
| 23 | F東京 | 18 | 38 | 12 | 2 | 4 | 42 | 10 | 32 |
| 24 | 鳥栖 | 18 | 35 | 9 | 8 | 1 | 32 | 18 | 14 |
| 25 | 町田 | 42 | 32 | 7 | 11 | 24 | 34 | 67 | -33 |
| 26 | 神戸 | 6 | 15 | 5 | 0 | 1 | 13 | 6 | 7 |
| 27 | G大阪 | 6 | 10 | 2 | 4 | 0 | 12 | 8 | 4 |
| 28 | 長崎 | 6 | 8 | 2 | 2 | 2 | 7 | 8 | -1 |
