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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 39 | 77 | 21 | 14 | 4 | 56 | 32 | 24 |
| 2 | 横浜F | 43 | 77 | 23 | 8 | 12 | 65 | 43 | 22 |
| 3 | 京都 | 43 | 76 | 23 | 7 | 13 | 65 | 48 | 17 |
| 4 | 千葉 | 43 | 71 | 20 | 11 | 12 | 60 | 33 | 27 |
| 5 | 大分 | 39 | 68 | 20 | 8 | 11 | 52 | 34 | 18 |
| 6 | 北九州 | 43 | 68 | 20 | 8 | 15 | 56 | 48 | 8 |
| 7 | 岡山 | 43 | 67 | 17 | 16 | 10 | 43 | 33 | 10 |
| 8 | 湘南 | 39 | 66 | 17 | 15 | 7 | 58 | 40 | 18 |
| 9 | 東京V | 43 | 63 | 18 | 9 | 16 | 60 | 45 | 15 |
| 10 | 松本 | 43 | 63 | 16 | 15 | 12 | 49 | 43 | 6 |
| 11 | 栃木 | 43 | 61 | 17 | 10 | 16 | 50 | 47 | 3 |
| 12 | 山形 | 43 | 61 | 16 | 13 | 14 | 52 | 50 | 2 |
| 13 | 熊本 | 43 | 56 | 15 | 11 | 17 | 42 | 51 | -9 |
| 14 | 水戸 | 43 | 52 | 13 | 13 | 17 | 45 | 53 | -8 |
| 15 | 愛媛 | 43 | 51 | 12 | 15 | 16 | 48 | 47 | 1 |
| 16 | 徳島 | 43 | 49 | 12 | 13 | 18 | 45 | 53 | -8 |
| 17 | 群馬 | 43 | 49 | 12 | 13 | 18 | 29 | 41 | -12 |
| 18 | 鳥取 | 43 | 45 | 13 | 6 | 24 | 36 | 74 | -38 |
| 19 | 富山 | 43 | 43 | 11 | 10 | 22 | 39 | 56 | -17 |
| 20 | 福岡 | 43 | 41 | 9 | 14 | 20 | 54 | 69 | -15 |
| 21 | 岐阜 | 43 | 35 | 7 | 14 | 22 | 25 | 56 | -31 |
| 22 | 町田 | 39 | 29 | 6 | 11 | 22 | 31 | 64 | -33 |
| 23 | 神戸 | 4 | 9 | 3 | 0 | 1 | 7 | 4 | 3 |
| 24 | G大阪 | 4 | 6 | 1 | 3 | 0 | 8 | 6 | 2 |
| 25 | 長崎 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 3 | 6 | -3 |
| 26 | 札幌 | 4 | 3 | 1 | 0 | 3 | 2 | 4 | -2 |
