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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 60 | 107 | 33 | 8 | 19 | 92 | 71 | 21 |
| 2 | 千葉 | 60 | 96 | 27 | 15 | 18 | 78 | 48 | 30 |
| 3 | 横浜F | 60 | 93 | 28 | 9 | 23 | 83 | 76 | 7 |
| 4 | 東京V | 60 | 92 | 26 | 14 | 20 | 90 | 64 | 26 |
| 5 | 湘南 | 56 | 89 | 24 | 17 | 15 | 89 | 65 | 24 |
| 6 | 大分 | 56 | 89 | 25 | 14 | 17 | 74 | 56 | 18 |
| 7 | 北九州 | 60 | 89 | 25 | 14 | 21 | 78 | 72 | 6 |
| 8 | 岡山 | 60 | 87 | 22 | 21 | 17 | 57 | 53 | 4 |
| 9 | 甲府 | 42 | 86 | 24 | 14 | 4 | 63 | 35 | 28 |
| 10 | 徳島 | 60 | 79 | 21 | 16 | 23 | 69 | 70 | -1 |
| 11 | 栃木 | 60 | 79 | 22 | 13 | 25 | 66 | 70 | -4 |
| 12 | 熊本 | 60 | 77 | 21 | 14 | 25 | 59 | 75 | -16 |
| 13 | 群馬 | 60 | 76 | 19 | 19 | 22 | 52 | 61 | -9 |
| 14 | 水戸 | 60 | 73 | 19 | 16 | 25 | 67 | 75 | -8 |
| 15 | 愛媛 | 60 | 69 | 15 | 24 | 21 | 70 | 73 | -3 |
| 16 | 山形 | 46 | 67 | 18 | 13 | 15 | 57 | 55 | 2 |
| 17 | 松本 | 46 | 66 | 17 | 15 | 14 | 51 | 47 | 4 |
| 18 | 富山 | 60 | 66 | 17 | 15 | 28 | 59 | 79 | -20 |
| 19 | 鳥取 | 60 | 57 | 16 | 9 | 35 | 51 | 110 | -59 |
| 20 | 岐阜 | 60 | 50 | 10 | 20 | 30 | 50 | 96 | -46 |
| 21 | 福岡 | 46 | 47 | 11 | 14 | 21 | 58 | 73 | -15 |
| 22 | 町田 | 42 | 32 | 7 | 11 | 24 | 34 | 67 | -33 |
| 23 | F東京 | 14 | 29 | 9 | 2 | 3 | 32 | 9 | 23 |
| 24 | 札幌 | 18 | 28 | 9 | 1 | 8 | 21 | 14 | 7 |
| 25 | 鳥栖 | 14 | 27 | 7 | 6 | 1 | 29 | 17 | 12 |
| 26 | 神戸 | 4 | 9 | 3 | 0 | 1 | 7 | 4 | 3 |
| 27 | G大阪 | 4 | 6 | 1 | 3 | 0 | 8 | 6 | 2 |
| 28 | 長崎 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 3 | 6 | -3 |
