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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 40 | 80 | 22 | 14 | 4 | 58 | 33 | 25 |
| 2 | 横浜F | 43 | 77 | 23 | 8 | 12 | 65 | 45 | 20 |
| 3 | 京都 | 43 | 76 | 23 | 7 | 13 | 63 | 47 | 16 |
| 4 | 千葉 | 43 | 73 | 21 | 10 | 12 | 62 | 32 | 30 |
| 5 | 湘南 | 40 | 69 | 18 | 15 | 7 | 61 | 41 | 20 |
| 6 | 大分 | 40 | 68 | 20 | 8 | 12 | 54 | 37 | 17 |
| 7 | 北九州 | 43 | 67 | 20 | 7 | 16 | 55 | 48 | 7 |
| 8 | 岡山 | 43 | 66 | 17 | 15 | 11 | 42 | 35 | 7 |
| 9 | 東京V | 43 | 65 | 19 | 8 | 16 | 63 | 45 | 18 |
| 10 | 栃木 | 43 | 64 | 18 | 10 | 15 | 50 | 45 | 5 |
| 11 | 松本 | 43 | 63 | 16 | 15 | 12 | 48 | 42 | 6 |
| 12 | 山形 | 43 | 61 | 16 | 13 | 14 | 53 | 51 | 2 |
| 13 | 熊本 | 43 | 55 | 15 | 10 | 18 | 40 | 51 | -11 |
| 14 | 水戸 | 43 | 54 | 14 | 12 | 17 | 47 | 52 | -5 |
| 15 | 愛媛 | 43 | 50 | 12 | 14 | 17 | 49 | 49 | 0 |
| 16 | 群馬 | 43 | 47 | 11 | 14 | 18 | 28 | 41 | -13 |
| 17 | 徳島 | 43 | 46 | 11 | 13 | 19 | 43 | 53 | -10 |
| 18 | 鳥取 | 43 | 44 | 13 | 5 | 25 | 35 | 76 | -41 |
| 19 | 富山 | 43 | 43 | 11 | 10 | 22 | 40 | 59 | -19 |
| 20 | 福岡 | 43 | 41 | 9 | 14 | 20 | 54 | 70 | -16 |
| 21 | 岐阜 | 43 | 35 | 7 | 14 | 22 | 25 | 56 | -31 |
| 22 | 町田 | 40 | 32 | 7 | 11 | 22 | 34 | 64 | -30 |
| 23 | 神戸 | 3 | 9 | 3 | 0 | 0 | 6 | 0 | 6 |
| 24 | G大阪 | 3 | 5 | 1 | 2 | 0 | 6 | 4 | 2 |
| 25 | 札幌 | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 1 | 2 | -1 |
| 26 | 長崎 | 3 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 6 | -4 |
