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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 46 | 79 | 24 | 7 | 15 | 76 | 50 | 26 |
| 2 | 横浜F | 46 | 76 | 21 | 13 | 12 | 58 | 45 | 13 |
| 3 | 千葉 | 46 | 74 | 20 | 14 | 12 | 66 | 46 | 20 |
| 4 | 松本 | 46 | 70 | 19 | 13 | 14 | 58 | 45 | 13 |
| 5 | 栃木 | 46 | 69 | 19 | 12 | 15 | 59 | 54 | 5 |
| 6 | 岡山 | 46 | 66 | 15 | 21 | 10 | 48 | 39 | 9 |
| 7 | 徳島 | 46 | 61 | 17 | 10 | 19 | 58 | 60 | -2 |
| 8 | 北九州 | 46 | 60 | 17 | 9 | 20 | 59 | 59 | 0 |
| 9 | 東京V | 46 | 58 | 14 | 16 | 16 | 54 | 54 | 0 |
| 10 | 水戸 | 46 | 58 | 15 | 13 | 18 | 52 | 58 | -6 |
| 11 | 熊本 | 46 | 58 | 16 | 10 | 20 | 52 | 65 | -13 |
| 12 | 山形 | 46 | 57 | 15 | 12 | 19 | 65 | 61 | 4 |
| 13 | 甲府 | 23 | 53 | 15 | 8 | 0 | 37 | 18 | 19 |
| 14 | 福岡 | 46 | 50 | 12 | 14 | 20 | 49 | 66 | -17 |
| 15 | G大阪 | 23 | 49 | 14 | 7 | 2 | 48 | 21 | 27 |
| 16 | 神戸 | 23 | 47 | 14 | 5 | 4 | 40 | 22 | 18 |
| 17 | 愛媛 | 46 | 47 | 12 | 11 | 23 | 43 | 59 | -16 |
| 18 | 鳥取 | 46 | 47 | 12 | 11 | 23 | 40 | 72 | -32 |
| 19 | 群馬 | 46 | 46 | 11 | 13 | 22 | 36 | 57 | -21 |
| 20 | 富山 | 46 | 46 | 11 | 13 | 22 | 43 | 66 | -23 |
| 21 | 長崎 | 23 | 42 | 12 | 6 | 5 | 28 | 22 | 6 |
| 22 | 湘南 | 23 | 39 | 10 | 9 | 4 | 33 | 20 | 13 |
| 23 | 岐阜 | 46 | 39 | 8 | 15 | 23 | 35 | 74 | -39 |
| 24 | 大分 | 23 | 37 | 11 | 4 | 8 | 32 | 22 | 10 |
| 25 | 札幌 | 23 | 32 | 10 | 2 | 11 | 27 | 24 | 3 |
| 26 | 町田 | 23 | 20 | 4 | 8 | 11 | 19 | 36 | -17 |
