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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 48 | 83 | 25 | 8 | 15 | 76 | 54 | 22 |
| 2 | 横浜F | 48 | 81 | 23 | 12 | 13 | 66 | 47 | 19 |
| 3 | 千葉 | 48 | 77 | 21 | 14 | 13 | 74 | 46 | 28 |
| 4 | 栃木 | 48 | 74 | 21 | 11 | 16 | 60 | 54 | 6 |
| 5 | 岡山 | 48 | 71 | 17 | 20 | 11 | 53 | 43 | 10 |
| 6 | 松本 | 48 | 70 | 18 | 16 | 14 | 56 | 47 | 9 |
| 7 | 東京V | 48 | 68 | 18 | 14 | 16 | 65 | 50 | 15 |
| 8 | 徳島 | 48 | 65 | 18 | 11 | 19 | 61 | 60 | 1 |
| 9 | 熊本 | 48 | 65 | 18 | 11 | 19 | 52 | 64 | -12 |
| 10 | 甲府 | 29 | 64 | 18 | 10 | 1 | 46 | 22 | 24 |
| 11 | 北九州 | 48 | 62 | 17 | 11 | 20 | 61 | 62 | -1 |
| 12 | 山形 | 48 | 59 | 15 | 14 | 19 | 67 | 63 | 4 |
| 13 | 水戸 | 48 | 56 | 14 | 14 | 20 | 55 | 63 | -8 |
| 14 | 愛媛 | 48 | 52 | 13 | 13 | 22 | 49 | 60 | -11 |
| 15 | 福岡 | 48 | 52 | 12 | 16 | 20 | 52 | 68 | -16 |
| 16 | 湘南 | 29 | 48 | 12 | 12 | 5 | 40 | 26 | 14 |
| 17 | 群馬 | 48 | 48 | 11 | 15 | 22 | 35 | 57 | -22 |
| 18 | 富山 | 48 | 48 | 12 | 12 | 24 | 42 | 68 | -26 |
| 19 | 大分 | 29 | 47 | 14 | 5 | 10 | 39 | 29 | 10 |
| 20 | 鳥取 | 48 | 46 | 12 | 10 | 26 | 40 | 84 | -44 |
| 21 | G大阪 | 19 | 42 | 12 | 6 | 1 | 37 | 15 | 22 |
| 22 | 岐阜 | 48 | 40 | 8 | 16 | 24 | 34 | 70 | -36 |
| 23 | 神戸 | 19 | 38 | 11 | 5 | 3 | 34 | 20 | 14 |
| 24 | 長崎 | 19 | 35 | 10 | 5 | 4 | 24 | 18 | 6 |
| 25 | 札幌 | 19 | 26 | 8 | 2 | 9 | 20 | 21 | -1 |
| 26 | 町田 | 29 | 21 | 4 | 9 | 16 | 22 | 49 | -27 |
