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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 42 | 86 | 24 | 14 | 4 | 63 | 35 | 28 |
| 2 | 京都 | 45 | 81 | 25 | 6 | 14 | 69 | 50 | 19 |
| 3 | 横浜F | 45 | 79 | 24 | 7 | 14 | 67 | 47 | 20 |
| 4 | 湘南 | 44 | 76 | 20 | 16 | 8 | 68 | 47 | 21 |
| 5 | 千葉 | 45 | 75 | 22 | 9 | 14 | 63 | 36 | 27 |
| 6 | 大分 | 44 | 72 | 21 | 9 | 14 | 62 | 44 | 18 |
| 7 | 東京V | 45 | 70 | 21 | 7 | 17 | 69 | 50 | 19 |
| 8 | 岡山 | 45 | 69 | 18 | 15 | 12 | 43 | 36 | 7 |
| 9 | 北九州 | 45 | 65 | 19 | 8 | 18 | 57 | 53 | 4 |
| 10 | 栃木 | 45 | 63 | 18 | 9 | 18 | 52 | 55 | -3 |
| 11 | 松本 | 43 | 62 | 16 | 14 | 13 | 47 | 43 | 4 |
| 12 | 山形 | 43 | 61 | 16 | 13 | 14 | 52 | 52 | 0 |
| 13 | 水戸 | 45 | 60 | 16 | 12 | 17 | 52 | 53 | -1 |
| 14 | 熊本 | 45 | 59 | 16 | 11 | 18 | 44 | 52 | -8 |
| 15 | 愛媛 | 45 | 56 | 14 | 14 | 17 | 55 | 51 | 4 |
| 16 | 群馬 | 45 | 54 | 14 | 12 | 19 | 38 | 47 | -9 |
| 17 | 徳島 | 45 | 51 | 13 | 12 | 20 | 45 | 54 | -9 |
| 18 | 福岡 | 43 | 44 | 10 | 14 | 19 | 54 | 68 | -14 |
| 19 | 富山 | 45 | 42 | 10 | 12 | 23 | 41 | 63 | -22 |
| 20 | 鳥取 | 45 | 41 | 12 | 5 | 28 | 38 | 86 | -48 |
| 21 | 岐阜 | 45 | 36 | 7 | 15 | 23 | 29 | 61 | -32 |
| 22 | 町田 | 42 | 32 | 7 | 11 | 24 | 34 | 67 | -33 |
| 23 | 札幌 | 3 | 9 | 3 | 0 | 0 | 5 | 1 | 4 |
| 24 | 鳥栖 | 2 | 4 | 1 | 1 | 0 | 5 | 2 | 3 |
| 25 | 神戸 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 |
| 26 | F東京 | 2 | 3 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 0 |
| 27 | G大阪 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 3 | 3 | 0 |
| 28 | 長崎 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 |
