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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 44 | 75 | 23 | 6 | 15 | 62 | 50 | 12 |
| 2 | 東京V | 44 | 71 | 20 | 11 | 13 | 79 | 49 | 30 |
| 3 | 鳥栖 | 35 | 69 | 19 | 12 | 4 | 66 | 29 | 37 |
| 4 | F東京 | 35 | 68 | 20 | 8 | 7 | 62 | 22 | 40 |
| 5 | 湘南 | 44 | 67 | 19 | 10 | 15 | 61 | 55 | 6 |
| 6 | 徳島 | 44 | 67 | 19 | 10 | 15 | 54 | 50 | 4 |
| 7 | 北九州 | 44 | 67 | 19 | 10 | 15 | 52 | 51 | 1 |
| 8 | 千葉 | 44 | 66 | 18 | 12 | 14 | 51 | 40 | 11 |
| 9 | 群馬 | 44 | 65 | 18 | 11 | 15 | 56 | 58 | -2 |
| 10 | 札幌 | 35 | 64 | 20 | 4 | 11 | 45 | 30 | 15 |
| 11 | 栃木 | 44 | 62 | 16 | 14 | 14 | 50 | 45 | 5 |
| 12 | 岡山 | 44 | 60 | 16 | 12 | 16 | 47 | 58 | -11 |
| 13 | 大分 | 44 | 59 | 15 | 14 | 15 | 52 | 52 | 0 |
| 14 | 水戸 | 44 | 54 | 14 | 12 | 18 | 44 | 48 | -4 |
| 15 | 熊本 | 44 | 53 | 13 | 14 | 17 | 40 | 54 | -14 |
| 16 | 愛媛 | 44 | 49 | 11 | 16 | 17 | 52 | 61 | -9 |
| 17 | 富山 | 44 | 45 | 11 | 12 | 21 | 44 | 64 | -20 |
| 18 | 横浜F | 44 | 44 | 11 | 11 | 22 | 45 | 65 | -20 |
| 19 | 鳥取 | 44 | 35 | 9 | 8 | 27 | 41 | 74 | -33 |
| 20 | 岐阜 | 44 | 29 | 7 | 8 | 29 | 43 | 93 | -50 |
| 21 | 山形 | 9 | 19 | 6 | 1 | 2 | 12 | 9 | 3 |
| 22 | 甲府 | 9 | 17 | 5 | 2 | 2 | 13 | 8 | 5 |
| 23 | 福岡 | 9 | 14 | 4 | 2 | 3 | 17 | 12 | 5 |
| 24 | 松本 | 9 | 10 | 3 | 1 | 5 | 6 | 11 | -5 |
| 25 | 町田 | 9 | 7 | 2 | 1 | 6 | 7 | 13 | -6 |
