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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 41 | 71 | 22 | 5 | 14 | 60 | 48 | 12 |
| 2 | 東京V | 41 | 70 | 20 | 10 | 11 | 77 | 45 | 32 |
| 3 | F東京 | 34 | 67 | 20 | 7 | 7 | 62 | 22 | 40 |
| 4 | 鳥栖 | 34 | 66 | 18 | 12 | 4 | 60 | 26 | 34 |
| 5 | 徳島 | 41 | 66 | 19 | 9 | 13 | 54 | 44 | 10 |
| 6 | 北九州 | 41 | 66 | 19 | 9 | 13 | 50 | 47 | 3 |
| 7 | 千葉 | 41 | 64 | 18 | 10 | 13 | 50 | 38 | 12 |
| 8 | 札幌 | 34 | 61 | 19 | 4 | 11 | 43 | 29 | 14 |
| 9 | 湘南 | 41 | 60 | 17 | 9 | 15 | 55 | 51 | 4 |
| 10 | 群馬 | 41 | 59 | 16 | 11 | 14 | 53 | 57 | -4 |
| 11 | 栃木 | 41 | 57 | 15 | 12 | 14 | 46 | 44 | 2 |
| 12 | 大分 | 41 | 55 | 14 | 13 | 14 | 49 | 49 | 0 |
| 13 | 岡山 | 41 | 53 | 14 | 11 | 16 | 42 | 57 | -15 |
| 14 | 熊本 | 41 | 51 | 13 | 12 | 16 | 39 | 50 | -11 |
| 15 | 水戸 | 41 | 50 | 13 | 11 | 17 | 41 | 45 | -4 |
| 16 | 愛媛 | 41 | 47 | 11 | 14 | 16 | 52 | 60 | -8 |
| 17 | 富山 | 41 | 42 | 10 | 12 | 19 | 41 | 60 | -19 |
| 18 | 横浜F | 41 | 40 | 10 | 10 | 21 | 39 | 59 | -20 |
| 19 | 鳥取 | 41 | 34 | 9 | 7 | 25 | 38 | 66 | -28 |
| 20 | 岐阜 | 41 | 25 | 6 | 7 | 28 | 40 | 89 | -49 |
| 21 | 甲府 | 7 | 15 | 5 | 0 | 2 | 12 | 7 | 5 |
| 22 | 山形 | 7 | 13 | 4 | 1 | 2 | 10 | 9 | 1 |
| 23 | 福岡 | 7 | 10 | 3 | 1 | 3 | 12 | 11 | 1 |
| 24 | 町田 | 7 | 6 | 2 | 0 | 5 | 6 | 9 | -3 |
| 25 | 松本 | 7 | 4 | 1 | 1 | 5 | 2 | 11 | -9 |
