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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | F東京 | 38 | 77 | 23 | 8 | 7 | 67 | 22 | 45 |
| 2 | 徳島 | 44 | 73 | 21 | 10 | 13 | 57 | 44 | 13 |
| 3 | 東京V | 44 | 72 | 20 | 12 | 12 | 81 | 50 | 31 |
| 4 | 札幌 | 39 | 71 | 22 | 5 | 12 | 53 | 32 | 21 |
| 5 | 鳥栖 | 39 | 69 | 19 | 12 | 8 | 69 | 36 | 33 |
| 6 | 千葉 | 44 | 69 | 19 | 12 | 13 | 55 | 42 | 13 |
| 7 | 京都 | 43 | 67 | 20 | 7 | 16 | 58 | 50 | 8 |
| 8 | 北九州 | 43 | 65 | 18 | 11 | 14 | 50 | 51 | -1 |
| 9 | 栃木 | 44 | 64 | 17 | 13 | 14 | 49 | 46 | 3 |
| 10 | 群馬 | 44 | 62 | 17 | 11 | 16 | 55 | 62 | -7 |
| 11 | 大分 | 44 | 60 | 15 | 15 | 14 | 54 | 53 | 1 |
| 12 | 湘南 | 43 | 59 | 16 | 11 | 16 | 59 | 55 | 4 |
| 13 | 熊本 | 44 | 55 | 14 | 13 | 17 | 39 | 57 | -18 |
| 14 | 愛媛 | 44 | 53 | 12 | 17 | 15 | 54 | 60 | -6 |
| 15 | 岡山 | 44 | 53 | 14 | 11 | 19 | 47 | 66 | -19 |
| 16 | 水戸 | 44 | 52 | 14 | 10 | 20 | 47 | 54 | -7 |
| 17 | 富山 | 44 | 46 | 11 | 13 | 20 | 43 | 65 | -22 |
| 18 | 横浜F | 44 | 44 | 11 | 11 | 22 | 43 | 63 | -20 |
| 19 | 鳥取 | 43 | 35 | 9 | 8 | 26 | 41 | 72 | -31 |
| 20 | 岐阜 | 44 | 27 | 6 | 9 | 29 | 42 | 92 | -50 |
| 21 | 甲府 | 6 | 13 | 4 | 1 | 1 | 10 | 5 | 5 |
| 21 | 福岡 | 6 | 13 | 4 | 1 | 1 | 10 | 5 | 5 |
| 23 | 山形 | 5 | 9 | 3 | 0 | 2 | 8 | 8 | 0 |
| 24 | 町田 | 5 | 6 | 2 | 0 | 3 | 5 | 5 | 0 |
| 25 | 松本 | 5 | 4 | 1 | 1 | 3 | 2 | 7 | -5 |
| 26 | 柏 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 4 | 0 | 4 |
