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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 41 | 85 | 24 | 13 | 4 | 63 | 35 | 28 |
| 2 | 京都 | 46 | 85 | 27 | 4 | 15 | 70 | 50 | 20 |
| 3 | 横浜F | 46 | 79 | 24 | 7 | 15 | 66 | 49 | 17 |
| 4 | 千葉 | 46 | 76 | 22 | 10 | 14 | 62 | 37 | 25 |
| 5 | 大分 | 46 | 75 | 22 | 9 | 15 | 65 | 48 | 17 |
| 6 | 東京V | 46 | 73 | 22 | 7 | 17 | 71 | 51 | 20 |
| 7 | 湘南 | 46 | 73 | 19 | 16 | 11 | 69 | 54 | 15 |
| 8 | 岡山 | 46 | 71 | 19 | 14 | 13 | 45 | 38 | 7 |
| 9 | 栃木 | 46 | 69 | 20 | 9 | 17 | 57 | 53 | 4 |
| 10 | 北九州 | 46 | 68 | 20 | 8 | 18 | 59 | 53 | 6 |
| 11 | 水戸 | 46 | 62 | 17 | 11 | 18 | 51 | 52 | -1 |
| 12 | 山形 | 41 | 61 | 16 | 13 | 12 | 51 | 47 | 4 |
| 13 | 群馬 | 46 | 60 | 16 | 12 | 18 | 40 | 46 | -6 |
| 14 | 熊本 | 46 | 59 | 16 | 11 | 19 | 44 | 54 | -10 |
| 15 | 松本 | 41 | 58 | 15 | 13 | 13 | 46 | 43 | 3 |
| 16 | 徳島 | 46 | 58 | 15 | 13 | 18 | 50 | 53 | -3 |
| 17 | 愛媛 | 46 | 52 | 12 | 16 | 18 | 56 | 56 | 0 |
| 18 | 福岡 | 41 | 41 | 9 | 14 | 18 | 52 | 66 | -14 |
| 19 | 富山 | 46 | 40 | 9 | 13 | 24 | 38 | 64 | -26 |
| 20 | 岐阜 | 46 | 39 | 8 | 15 | 23 | 30 | 60 | -30 |
| 21 | 鳥取 | 46 | 35 | 10 | 5 | 31 | 35 | 95 | -60 |
| 22 | 町田 | 41 | 32 | 7 | 11 | 23 | 34 | 64 | -30 |
| 23 | F東京 | 5 | 12 | 4 | 0 | 1 | 11 | 4 | 7 |
| 24 | 札幌 | 5 | 9 | 3 | 0 | 2 | 8 | 5 | 3 |
| 25 | 鳥栖 | 5 | 8 | 2 | 2 | 1 | 11 | 7 | 4 |
