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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 徳島 | 46 | 79 | 23 | 10 | 13 | 60 | 42 | 18 |
| 2 | F東京 | 38 | 77 | 23 | 8 | 7 | 67 | 22 | 45 |
| 3 | 札幌 | 42 | 75 | 23 | 6 | 13 | 54 | 33 | 21 |
| 4 | 鳥栖 | 42 | 74 | 20 | 14 | 8 | 71 | 37 | 34 |
| 5 | 東京V | 45 | 72 | 20 | 12 | 13 | 82 | 53 | 29 |
| 6 | 千葉 | 46 | 72 | 20 | 12 | 14 | 55 | 45 | 10 |
| 7 | 群馬 | 46 | 71 | 20 | 11 | 15 | 62 | 62 | 0 |
| 8 | 栃木 | 46 | 66 | 18 | 12 | 16 | 53 | 50 | 3 |
| 9 | 京都 | 42 | 64 | 19 | 7 | 16 | 56 | 49 | 7 |
| 10 | 北九州 | 45 | 62 | 17 | 11 | 17 | 48 | 55 | -7 |
| 11 | 熊本 | 46 | 61 | 16 | 13 | 17 | 42 | 56 | -14 |
| 12 | 大分 | 46 | 59 | 14 | 17 | 15 | 54 | 56 | -2 |
| 13 | 湘南 | 42 | 58 | 16 | 10 | 16 | 56 | 52 | 4 |
| 14 | 愛媛 | 46 | 55 | 13 | 16 | 17 | 55 | 62 | -7 |
| 15 | 水戸 | 46 | 55 | 15 | 10 | 21 | 50 | 58 | -8 |
| 16 | 岡山 | 46 | 51 | 13 | 12 | 21 | 48 | 70 | -22 |
| 17 | 富山 | 46 | 49 | 12 | 13 | 21 | 43 | 67 | -24 |
| 18 | 横浜F | 46 | 47 | 12 | 11 | 23 | 44 | 64 | -20 |
| 19 | 鳥取 | 42 | 35 | 9 | 8 | 25 | 41 | 68 | -27 |
| 20 | 岐阜 | 45 | 30 | 7 | 9 | 29 | 46 | 94 | -48 |
| 21 | 福岡 | 8 | 17 | 5 | 2 | 1 | 11 | 7 | 4 |
| 22 | 甲府 | 7 | 11 | 3 | 2 | 2 | 12 | 11 | 1 |
| 23 | 山形 | 4 | 9 | 3 | 0 | 1 | 7 | 6 | 1 |
| 24 | 柏 | 4 | 8 | 2 | 2 | 0 | 8 | 2 | 6 |
| 25 | 町田 | 4 | 6 | 2 | 0 | 2 | 4 | 3 | 1 |
| 26 | 松本 | 4 | 3 | 1 | 0 | 3 | 2 | 7 | -5 |
