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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 徳島 | 49 | 82 | 24 | 10 | 15 | 63 | 46 | 17 |
| 2 | 鳥栖 | 45 | 80 | 22 | 14 | 9 | 73 | 39 | 34 |
| 3 | 札幌 | 45 | 79 | 24 | 7 | 14 | 56 | 35 | 21 |
| 4 | F東京 | 38 | 77 | 23 | 8 | 7 | 67 | 22 | 45 |
| 5 | 群馬 | 49 | 77 | 22 | 11 | 16 | 65 | 64 | 1 |
| 6 | 東京V | 48 | 75 | 21 | 12 | 15 | 86 | 58 | 28 |
| 7 | 千葉 | 49 | 75 | 21 | 12 | 16 | 58 | 49 | 9 |
| 8 | 栃木 | 49 | 69 | 19 | 12 | 18 | 57 | 56 | 1 |
| 9 | 熊本 | 48 | 65 | 17 | 14 | 17 | 45 | 57 | -12 |
| 10 | 京都 | 42 | 64 | 19 | 7 | 16 | 56 | 49 | 7 |
| 11 | 大分 | 49 | 63 | 15 | 18 | 16 | 55 | 57 | -2 |
| 12 | 北九州 | 48 | 62 | 17 | 11 | 20 | 49 | 66 | -17 |
| 13 | 愛媛 | 48 | 61 | 15 | 16 | 17 | 59 | 62 | -3 |
| 14 | 湘南 | 42 | 58 | 16 | 10 | 16 | 56 | 52 | 4 |
| 15 | 岡山 | 49 | 57 | 15 | 12 | 22 | 52 | 73 | -21 |
| 16 | 水戸 | 49 | 56 | 15 | 11 | 23 | 52 | 64 | -12 |
| 17 | 横浜F | 49 | 53 | 14 | 11 | 24 | 46 | 65 | -19 |
| 18 | 富山 | 49 | 53 | 13 | 14 | 22 | 48 | 72 | -24 |
| 19 | 鳥取 | 42 | 35 | 9 | 8 | 25 | 41 | 68 | -27 |
| 20 | 岐阜 | 48 | 30 | 7 | 9 | 32 | 46 | 99 | -53 |
| 21 | 福岡 | 11 | 21 | 6 | 3 | 2 | 16 | 12 | 4 |
| 22 | 甲府 | 10 | 20 | 6 | 2 | 2 | 22 | 12 | 10 |
| 23 | 柏 | 6 | 14 | 4 | 2 | 0 | 15 | 3 | 12 |
| 24 | 山形 | 4 | 9 | 3 | 0 | 1 | 7 | 6 | 1 |
| 25 | 町田 | 4 | 6 | 2 | 0 | 2 | 4 | 3 | 1 |
| 26 | 松本 | 4 | 3 | 1 | 0 | 3 | 2 | 7 | -5 |
