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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 39 | 81 | 23 | 12 | 4 | 61 | 35 | 26 |
| 2 | 京都 | 40 | 73 | 23 | 4 | 13 | 62 | 44 | 18 |
| 3 | 湘南 | 40 | 67 | 17 | 16 | 7 | 62 | 45 | 17 |
| 4 | 横浜F | 40 | 67 | 20 | 7 | 13 | 57 | 43 | 14 |
| 5 | 千葉 | 40 | 66 | 19 | 9 | 12 | 56 | 34 | 22 |
| 6 | 大分 | 40 | 65 | 19 | 8 | 13 | 57 | 42 | 15 |
| 7 | 東京V | 40 | 64 | 19 | 7 | 14 | 65 | 45 | 20 |
| 8 | 山形 | 39 | 61 | 16 | 13 | 10 | 51 | 42 | 9 |
| 9 | 岡山 | 40 | 61 | 16 | 13 | 11 | 38 | 33 | 5 |
| 10 | 松本 | 39 | 58 | 15 | 13 | 11 | 44 | 38 | 6 |
| 11 | 栃木 | 40 | 57 | 16 | 9 | 15 | 45 | 47 | -2 |
| 12 | 北九州 | 40 | 56 | 16 | 8 | 16 | 50 | 48 | 2 |
| 13 | 水戸 | 40 | 54 | 15 | 9 | 16 | 46 | 47 | -1 |
| 14 | 熊本 | 40 | 53 | 14 | 11 | 15 | 41 | 47 | -6 |
| 15 | 群馬 | 40 | 50 | 13 | 11 | 16 | 34 | 38 | -4 |
| 16 | 徳島 | 40 | 47 | 12 | 11 | 17 | 43 | 46 | -3 |
| 17 | 愛媛 | 40 | 46 | 11 | 13 | 16 | 47 | 47 | 0 |
| 18 | 福岡 | 39 | 41 | 9 | 14 | 16 | 52 | 63 | -11 |
| 19 | 富山 | 40 | 35 | 8 | 11 | 21 | 35 | 57 | -22 |
| 20 | 鳥取 | 40 | 35 | 10 | 5 | 25 | 33 | 79 | -46 |
| 21 | 岐阜 | 40 | 34 | 7 | 13 | 20 | 26 | 54 | -28 |
| 22 | 町田 | 39 | 28 | 6 | 10 | 23 | 32 | 63 | -31 |
| 23 | 札幌 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | 1 |
| 24 | 鳥栖 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 2 | 2 | 0 |
| 25 | F東京 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 |
