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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 徳島 | 45 | 78 | 23 | 9 | 13 | 60 | 42 | 18 |
| 2 | F東京 | 38 | 77 | 23 | 8 | 7 | 67 | 22 | 45 |
| 3 | 札幌 | 42 | 75 | 23 | 6 | 13 | 54 | 33 | 21 |
| 4 | 鳥栖 | 42 | 74 | 20 | 14 | 8 | 71 | 37 | 34 |
| 5 | 東京V | 44 | 71 | 20 | 11 | 13 | 82 | 53 | 29 |
| 6 | 千葉 | 45 | 71 | 20 | 11 | 14 | 55 | 45 | 10 |
| 7 | 群馬 | 45 | 70 | 20 | 10 | 15 | 62 | 62 | 0 |
| 8 | 栃木 | 45 | 65 | 18 | 11 | 16 | 53 | 50 | 3 |
| 9 | 京都 | 41 | 64 | 19 | 7 | 15 | 55 | 47 | 8 |
| 10 | 熊本 | 45 | 61 | 16 | 13 | 16 | 42 | 55 | -13 |
| 11 | 北九州 | 44 | 59 | 16 | 11 | 17 | 47 | 55 | -8 |
| 12 | 大分 | 45 | 56 | 13 | 17 | 15 | 53 | 56 | -3 |
| 13 | 湘南 | 41 | 55 | 15 | 10 | 16 | 54 | 51 | 3 |
| 14 | 水戸 | 45 | 55 | 15 | 10 | 20 | 50 | 57 | -7 |
| 15 | 愛媛 | 45 | 52 | 12 | 16 | 17 | 52 | 62 | -10 |
| 16 | 岡山 | 45 | 51 | 13 | 12 | 20 | 48 | 69 | -21 |
| 17 | 富山 | 45 | 48 | 12 | 12 | 21 | 43 | 67 | -24 |
| 18 | 横浜F | 45 | 46 | 12 | 10 | 23 | 44 | 64 | -20 |
| 19 | 鳥取 | 41 | 32 | 8 | 8 | 25 | 39 | 67 | -28 |
| 20 | 岐阜 | 44 | 30 | 7 | 9 | 28 | 45 | 92 | -47 |
| 21 | 福岡 | 7 | 16 | 5 | 1 | 1 | 11 | 7 | 4 |
| 22 | 甲府 | 6 | 11 | 3 | 2 | 1 | 11 | 9 | 2 |
| 23 | 柏 | 4 | 8 | 2 | 2 | 0 | 8 | 2 | 6 |
| 24 | 山形 | 3 | 6 | 2 | 0 | 1 | 5 | 5 | 0 |
| 25 | 町田 | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 3 | 3 | 0 |
| 26 | 松本 | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 2 | 4 | -2 |
