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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 徳島 | 50 | 84 | 25 | 9 | 16 | 64 | 47 | 17 |
| 2 | 札幌 | 47 | 83 | 25 | 8 | 14 | 59 | 36 | 23 |
| 3 | 鳥栖 | 47 | 81 | 22 | 15 | 10 | 77 | 44 | 33 |
| 4 | 東京V | 49 | 80 | 23 | 11 | 15 | 88 | 58 | 30 |
| 5 | F東京 | 38 | 77 | 23 | 8 | 7 | 67 | 22 | 45 |
| 6 | 千葉 | 50 | 77 | 22 | 11 | 17 | 59 | 50 | 9 |
| 7 | 群馬 | 50 | 77 | 22 | 11 | 17 | 66 | 66 | 0 |
| 8 | 栃木 | 49 | 71 | 20 | 11 | 18 | 59 | 56 | 3 |
| 9 | 大分 | 50 | 66 | 16 | 18 | 16 | 56 | 57 | -1 |
| 10 | 熊本 | 49 | 66 | 17 | 15 | 17 | 45 | 57 | -12 |
| 11 | 京都 | 41 | 64 | 19 | 7 | 15 | 55 | 47 | 8 |
| 12 | 愛媛 | 49 | 60 | 14 | 18 | 17 | 57 | 63 | -6 |
| 13 | 北九州 | 49 | 59 | 16 | 11 | 22 | 48 | 70 | -22 |
| 14 | 岡山 | 50 | 58 | 15 | 13 | 22 | 54 | 75 | -21 |
| 15 | 水戸 | 50 | 57 | 15 | 12 | 23 | 52 | 64 | -12 |
| 16 | 横浜F | 50 | 56 | 15 | 11 | 24 | 51 | 69 | -18 |
| 17 | 湘南 | 41 | 55 | 15 | 10 | 16 | 54 | 51 | 3 |
| 18 | 富山 | 49 | 52 | 13 | 13 | 23 | 48 | 74 | -26 |
| 19 | 鳥取 | 41 | 32 | 8 | 8 | 25 | 39 | 67 | -28 |
| 20 | 岐阜 | 49 | 32 | 7 | 11 | 31 | 47 | 99 | -52 |
| 21 | 福岡 | 12 | 26 | 8 | 2 | 2 | 20 | 13 | 7 |
| 22 | 甲府 | 11 | 22 | 6 | 4 | 1 | 23 | 12 | 11 |
| 23 | 柏 | 8 | 15 | 4 | 3 | 1 | 15 | 4 | 11 |
| 24 | 山形 | 3 | 6 | 2 | 0 | 1 | 5 | 5 | 0 |
| 25 | 町田 | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 3 | 3 | 0 |
| 26 | 松本 | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 2 | 4 | -2 |
