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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 徳島 | 44 | 78 | 23 | 9 | 12 | 60 | 41 | 19 |
| 2 | F東京 | 38 | 77 | 23 | 8 | 7 | 67 | 22 | 45 |
| 3 | 札幌 | 42 | 75 | 23 | 6 | 13 | 54 | 33 | 21 |
| 4 | 鳥栖 | 42 | 74 | 20 | 14 | 8 | 71 | 37 | 34 |
| 5 | 群馬 | 44 | 69 | 20 | 9 | 15 | 62 | 62 | 0 |
| 6 | 東京V | 43 | 68 | 19 | 11 | 13 | 78 | 52 | 26 |
| 7 | 千葉 | 44 | 68 | 19 | 11 | 14 | 52 | 45 | 7 |
| 8 | 栃木 | 44 | 62 | 17 | 11 | 16 | 52 | 50 | 2 |
| 9 | 京都 | 40 | 61 | 18 | 7 | 15 | 53 | 47 | 6 |
| 10 | 熊本 | 44 | 61 | 16 | 13 | 15 | 42 | 53 | -11 |
| 11 | 北九州 | 43 | 59 | 16 | 11 | 16 | 47 | 54 | -7 |
| 12 | 大分 | 44 | 56 | 13 | 17 | 14 | 51 | 53 | -2 |
| 13 | 湘南 | 40 | 52 | 14 | 10 | 16 | 51 | 50 | 1 |
| 14 | 愛媛 | 44 | 52 | 12 | 16 | 16 | 51 | 60 | -9 |
| 15 | 水戸 | 44 | 52 | 14 | 10 | 20 | 47 | 57 | -10 |
| 16 | 岡山 | 44 | 51 | 13 | 12 | 19 | 48 | 66 | -18 |
| 17 | 富山 | 44 | 48 | 12 | 12 | 20 | 42 | 63 | -21 |
| 18 | 横浜F | 44 | 46 | 12 | 10 | 22 | 44 | 61 | -17 |
| 19 | 鳥取 | 40 | 32 | 8 | 8 | 24 | 39 | 64 | -25 |
| 20 | 岐阜 | 43 | 29 | 7 | 8 | 28 | 45 | 92 | -47 |
| 21 | 福岡 | 6 | 16 | 5 | 1 | 0 | 10 | 4 | 6 |
| 22 | 柏 | 4 | 8 | 2 | 2 | 0 | 8 | 2 | 6 |
| 23 | 甲府 | 5 | 8 | 2 | 2 | 1 | 9 | 8 | 1 |
| 24 | 山形 | 2 | 3 | 1 | 0 | 1 | 2 | 3 | -1 |
| 25 | 松本 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 1 | 4 | -3 |
| 26 | 町田 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 3 | -3 |
