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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 京都 | 45 | 75 | 23 | 6 | 16 | 63 | 52 | 11 |
| 2 | 東京V | 45 | 74 | 21 | 11 | 13 | 82 | 50 | 32 |
| 3 | 北九州 | 45 | 70 | 20 | 10 | 15 | 54 | 51 | 3 |
| 4 | 鳥栖 | 35 | 69 | 19 | 12 | 4 | 66 | 29 | 37 |
| 5 | F東京 | 35 | 68 | 20 | 8 | 7 | 62 | 22 | 40 |
| 6 | 千葉 | 45 | 67 | 18 | 13 | 14 | 52 | 41 | 11 |
| 7 | 湘南 | 45 | 67 | 19 | 10 | 16 | 62 | 57 | 5 |
| 8 | 徳島 | 45 | 67 | 19 | 10 | 16 | 54 | 52 | 2 |
| 9 | 群馬 | 45 | 65 | 18 | 11 | 16 | 56 | 60 | -4 |
| 10 | 札幌 | 35 | 64 | 20 | 4 | 11 | 45 | 30 | 15 |
| 11 | 栃木 | 45 | 62 | 16 | 14 | 15 | 51 | 47 | 4 |
| 12 | 大分 | 45 | 62 | 16 | 14 | 15 | 54 | 53 | 1 |
| 13 | 岡山 | 45 | 61 | 16 | 13 | 16 | 47 | 58 | -11 |
| 14 | 水戸 | 45 | 57 | 15 | 12 | 18 | 46 | 49 | -3 |
| 15 | 熊本 | 45 | 54 | 13 | 15 | 17 | 40 | 54 | -14 |
| 16 | 愛媛 | 45 | 52 | 12 | 16 | 17 | 56 | 62 | -6 |
| 17 | 横浜F | 45 | 47 | 12 | 11 | 22 | 47 | 65 | -18 |
| 18 | 富山 | 45 | 46 | 11 | 13 | 21 | 45 | 65 | -20 |
| 19 | 鳥取 | 45 | 35 | 9 | 8 | 28 | 42 | 78 | -36 |
| 20 | 岐阜 | 45 | 29 | 7 | 8 | 30 | 43 | 95 | -52 |
| 21 | 山形 | 10 | 22 | 7 | 1 | 2 | 14 | 10 | 4 |
| 22 | 甲府 | 10 | 20 | 6 | 2 | 2 | 15 | 8 | 7 |
| 23 | 福岡 | 10 | 14 | 4 | 2 | 4 | 18 | 15 | 3 |
| 24 | 松本 | 10 | 13 | 4 | 1 | 5 | 7 | 11 | -4 |
| 25 | 町田 | 10 | 7 | 2 | 1 | 7 | 7 | 14 | -7 |
