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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 46 | 82 | 25 | 7 | 14 | 58 | 35 | 23 |
| 2 | 鳥栖 | 46 | 80 | 22 | 14 | 10 | 73 | 40 | 33 |
| 3 | 徳島 | 47 | 78 | 23 | 9 | 15 | 60 | 46 | 14 |
| 4 | F東京 | 38 | 77 | 23 | 8 | 7 | 67 | 22 | 45 |
| 5 | 群馬 | 47 | 76 | 22 | 10 | 15 | 64 | 61 | 3 |
| 6 | 東京V | 46 | 74 | 21 | 11 | 14 | 82 | 54 | 28 |
| 7 | 千葉 | 47 | 71 | 20 | 11 | 16 | 55 | 48 | 7 |
| 8 | 栃木 | 46 | 65 | 18 | 11 | 17 | 56 | 53 | 3 |
| 9 | 熊本 | 46 | 63 | 16 | 15 | 15 | 43 | 53 | -10 |
| 10 | 大分 | 47 | 60 | 14 | 18 | 15 | 50 | 54 | -4 |
| 11 | 京都 | 39 | 58 | 17 | 7 | 15 | 51 | 47 | 4 |
| 12 | 愛媛 | 46 | 58 | 14 | 16 | 16 | 56 | 61 | -5 |
| 13 | 北九州 | 46 | 58 | 16 | 10 | 20 | 48 | 67 | -19 |
| 14 | 岡山 | 47 | 57 | 15 | 12 | 20 | 54 | 71 | -17 |
| 15 | 横浜F | 47 | 54 | 15 | 9 | 23 | 47 | 62 | -15 |
| 16 | 富山 | 47 | 52 | 13 | 13 | 21 | 47 | 69 | -22 |
| 17 | 水戸 | 47 | 51 | 13 | 12 | 22 | 48 | 63 | -15 |
| 18 | 湘南 | 39 | 49 | 13 | 10 | 16 | 48 | 49 | -1 |
| 19 | 鳥取 | 39 | 32 | 8 | 8 | 23 | 38 | 62 | -24 |
| 20 | 岐阜 | 46 | 30 | 7 | 9 | 30 | 47 | 96 | -49 |
| 21 | 福岡 | 9 | 20 | 6 | 2 | 1 | 16 | 9 | 7 |
| 22 | 柏 | 7 | 15 | 4 | 3 | 0 | 15 | 3 | 12 |
| 23 | 甲府 | 8 | 15 | 4 | 3 | 1 | 17 | 9 | 8 |
| 24 | 町田 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | -2 |
| 24 | 松本 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | -2 |
| 24 | 山形 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | -2 |
