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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 鳥栖 | 51 | 87 | 24 | 15 | 12 | 81 | 47 | 34 |
| 2 | 群馬 | 52 | 85 | 25 | 10 | 17 | 69 | 66 | 3 |
| 3 | 東京V | 51 | 84 | 24 | 12 | 15 | 90 | 57 | 33 |
| 4 | 札幌 | 50 | 84 | 25 | 9 | 16 | 60 | 42 | 18 |
| 5 | 徳島 | 51 | 81 | 24 | 9 | 18 | 64 | 52 | 12 |
| 6 | 千葉 | 51 | 80 | 23 | 11 | 17 | 61 | 52 | 9 |
| 7 | F東京 | 38 | 77 | 23 | 8 | 7 | 67 | 22 | 45 |
| 8 | 栃木 | 51 | 73 | 20 | 13 | 18 | 61 | 56 | 5 |
| 9 | 熊本 | 51 | 67 | 17 | 16 | 18 | 48 | 62 | -14 |
| 10 | 愛媛 | 51 | 66 | 16 | 18 | 17 | 60 | 63 | -3 |
| 11 | 大分 | 51 | 65 | 15 | 20 | 16 | 53 | 58 | -5 |
| 12 | 横浜F | 52 | 62 | 17 | 11 | 24 | 58 | 70 | -12 |
| 13 | 岡山 | 52 | 62 | 16 | 14 | 22 | 59 | 80 | -21 |
| 14 | 北九州 | 51 | 60 | 16 | 12 | 23 | 51 | 77 | -26 |
| 15 | 京都 | 39 | 58 | 17 | 7 | 15 | 51 | 47 | 4 |
| 16 | 水戸 | 52 | 57 | 14 | 15 | 23 | 54 | 68 | -14 |
| 17 | 富山 | 51 | 52 | 13 | 13 | 25 | 49 | 80 | -31 |
| 18 | 湘南 | 39 | 49 | 13 | 10 | 16 | 48 | 49 | -1 |
| 19 | 岐阜 | 51 | 38 | 9 | 11 | 31 | 52 | 99 | -47 |
| 20 | 鳥取 | 39 | 32 | 8 | 8 | 23 | 38 | 62 | -24 |
| 21 | 福岡 | 14 | 29 | 9 | 2 | 3 | 23 | 15 | 8 |
| 22 | 柏 | 12 | 25 | 7 | 4 | 1 | 26 | 8 | 18 |
| 23 | 甲府 | 13 | 24 | 6 | 6 | 1 | 28 | 13 | 15 |
| 24 | 町田 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | -2 |
| 24 | 山形 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | -2 |
| 24 | 松本 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | -2 |
