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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 鳥栖 | 60 | 99 | 28 | 15 | 17 | 85 | 62 | 23 |
| 2 | 甲府 | 51 | 97 | 27 | 16 | 8 | 91 | 55 | 36 |
| 3 | 福岡 | 51 | 95 | 28 | 11 | 12 | 81 | 47 | 34 |
| 4 | 熊本 | 60 | 91 | 25 | 16 | 19 | 66 | 70 | -4 |
| 5 | 東京V | 60 | 90 | 26 | 12 | 22 | 80 | 71 | 9 |
| 6 | 群馬 | 60 | 89 | 26 | 11 | 23 | 66 | 79 | -13 |
| 7 | 札幌 | 60 | 85 | 22 | 19 | 19 | 69 | 64 | 5 |
| 8 | 徳島 | 60 | 83 | 24 | 11 | 25 | 76 | 66 | 10 |
| 9 | 栃木 | 60 | 82 | 23 | 13 | 24 | 71 | 69 | 2 |
| 10 | 横浜F | 60 | 81 | 23 | 12 | 25 | 77 | 77 | 0 |
| 11 | 柏 | 36 | 80 | 23 | 11 | 2 | 71 | 24 | 47 |
| 12 | 千葉 | 45 | 71 | 21 | 8 | 16 | 67 | 46 | 21 |
| 13 | 岐阜 | 60 | 70 | 20 | 10 | 30 | 65 | 84 | -19 |
| 14 | 愛媛 | 60 | 69 | 16 | 21 | 23 | 51 | 61 | -10 |
| 15 | 水戸 | 60 | 59 | 14 | 17 | 29 | 50 | 87 | -37 |
| 16 | 大分 | 45 | 56 | 14 | 14 | 17 | 48 | 56 | -8 |
| 17 | 岡山 | 60 | 48 | 12 | 12 | 36 | 48 | 98 | -50 |
| 18 | 富山 | 60 | 46 | 12 | 10 | 38 | 56 | 106 | -50 |
| 19 | 湘南 | 24 | 40 | 11 | 7 | 6 | 32 | 21 | 11 |
| 20 | 仙台 | 15 | 36 | 11 | 3 | 1 | 28 | 9 | 19 |
| 21 | C大阪 | 15 | 33 | 10 | 3 | 2 | 27 | 10 | 17 |
| 22 | 北九州 | 45 | 27 | 4 | 15 | 26 | 29 | 75 | -46 |
| 23 | F東京 | 9 | 17 | 5 | 2 | 2 | 9 | 5 | 4 |
| 24 | 京都 | 9 | 14 | 4 | 2 | 3 | 10 | 6 | 4 |
| 25 | 鳥取 | 9 | 6 | 1 | 3 | 5 | 8 | 13 | -5 |
