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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 53 | 103 | 29 | 16 | 8 | 93 | 55 | 38 |
| 2 | 福岡 | 53 | 98 | 29 | 11 | 13 | 84 | 49 | 35 |
| 3 | 鳥栖 | 60 | 97 | 27 | 16 | 17 | 84 | 63 | 21 |
| 4 | 東京V | 60 | 90 | 26 | 12 | 22 | 79 | 70 | 9 |
| 5 | 札幌 | 60 | 88 | 23 | 19 | 18 | 77 | 68 | 9 |
| 6 | 熊本 | 60 | 88 | 24 | 16 | 20 | 65 | 72 | -7 |
| 7 | 群馬 | 60 | 83 | 24 | 11 | 25 | 66 | 85 | -19 |
| 8 | 横浜F | 60 | 81 | 23 | 12 | 25 | 78 | 77 | 1 |
| 9 | 柏 | 36 | 80 | 23 | 11 | 2 | 71 | 24 | 47 |
| 10 | 徳島 | 60 | 80 | 23 | 11 | 26 | 74 | 66 | 8 |
| 11 | 栃木 | 60 | 76 | 21 | 13 | 26 | 68 | 73 | -5 |
| 12 | 愛媛 | 60 | 72 | 17 | 21 | 22 | 54 | 59 | -5 |
| 13 | 岐阜 | 60 | 70 | 20 | 10 | 30 | 66 | 85 | -19 |
| 14 | 千葉 | 43 | 68 | 20 | 8 | 15 | 64 | 45 | 19 |
| 15 | 水戸 | 60 | 62 | 15 | 17 | 28 | 52 | 86 | -34 |
| 16 | 大分 | 43 | 55 | 14 | 13 | 16 | 47 | 54 | -7 |
| 17 | 岡山 | 60 | 50 | 13 | 11 | 36 | 51 | 101 | -50 |
| 18 | 富山 | 60 | 48 | 13 | 9 | 38 | 56 | 104 | -48 |
| 19 | 湘南 | 24 | 41 | 11 | 8 | 5 | 33 | 21 | 12 |
| 20 | 仙台 | 17 | 40 | 12 | 4 | 1 | 31 | 11 | 20 |
| 21 | C大阪 | 17 | 36 | 11 | 3 | 3 | 29 | 11 | 18 |
| 22 | 北九州 | 43 | 24 | 3 | 15 | 25 | 26 | 73 | -47 |
| 23 | F東京 | 7 | 16 | 5 | 1 | 1 | 9 | 2 | 7 |
| 24 | 京都 | 7 | 11 | 3 | 2 | 2 | 8 | 4 | 4 |
| 25 | 鳥取 | 7 | 2 | 0 | 2 | 5 | 6 | 13 | -7 |
