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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 甲府 | 62 | 118 | 33 | 19 | 10 | 106 | 66 | 40 |
| 2 | 福岡 | 62 | 111 | 32 | 15 | 15 | 95 | 65 | 30 |
| 3 | 鳥栖 | 66 | 103 | 28 | 19 | 19 | 88 | 71 | 17 |
| 4 | 札幌 | 66 | 98 | 26 | 20 | 20 | 85 | 72 | 13 |
| 5 | 東京V | 66 | 97 | 28 | 13 | 25 | 89 | 74 | 15 |
| 6 | 熊本 | 66 | 91 | 25 | 16 | 25 | 75 | 91 | -16 |
| 7 | 徳島 | 66 | 90 | 26 | 12 | 28 | 87 | 74 | 13 |
| 8 | 横浜F | 66 | 87 | 25 | 12 | 29 | 83 | 88 | -5 |
| 9 | 群馬 | 66 | 87 | 25 | 12 | 29 | 68 | 91 | -23 |
| 10 | 岐阜 | 66 | 82 | 23 | 13 | 30 | 73 | 89 | -16 |
| 11 | 柏 | 36 | 80 | 23 | 11 | 2 | 71 | 24 | 47 |
| 12 | 栃木 | 66 | 78 | 21 | 15 | 30 | 70 | 83 | -13 |
| 13 | 愛媛 | 66 | 75 | 18 | 21 | 27 | 59 | 76 | -17 |
| 14 | 水戸 | 66 | 75 | 19 | 18 | 29 | 68 | 91 | -23 |
| 15 | 千葉 | 40 | 68 | 20 | 8 | 12 | 64 | 42 | 22 |
| 16 | 富山 | 66 | 65 | 18 | 11 | 37 | 69 | 107 | -38 |
| 17 | 岡山 | 66 | 58 | 15 | 13 | 38 | 58 | 104 | -46 |
| 18 | 仙台 | 26 | 56 | 17 | 5 | 4 | 46 | 22 | 24 |
| 19 | C大阪 | 26 | 51 | 15 | 6 | 5 | 49 | 24 | 25 |
| 20 | 湘南 | 30 | 49 | 14 | 7 | 9 | 43 | 34 | 9 |
| 21 | 大分 | 40 | 48 | 12 | 12 | 16 | 43 | 52 | -9 |
| 22 | 北九州 | 40 | 20 | 2 | 14 | 24 | 23 | 70 | -47 |
| 23 | F東京 | 4 | 10 | 3 | 1 | 0 | 5 | 0 | 5 |
| 24 | 京都 | 4 | 2 | 0 | 2 | 2 | 2 | 4 | -2 |
| 25 | 鳥取 | 4 | 1 | 0 | 1 | 3 | 4 | 9 | -5 |
