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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 鳥栖 | 49 | 83 | 23 | 14 | 12 | 76 | 45 | 31 |
| 2 | 徳島 | 48 | 78 | 23 | 9 | 16 | 62 | 47 | 15 |
| 3 | 札幌 | 48 | 78 | 23 | 9 | 16 | 56 | 41 | 15 |
| 4 | 東京V | 48 | 77 | 22 | 11 | 15 | 84 | 54 | 30 |
| 5 | 群馬 | 49 | 76 | 22 | 10 | 17 | 60 | 63 | -3 |
| 6 | F東京 | 36 | 74 | 22 | 8 | 6 | 65 | 20 | 45 |
| 7 | 千葉 | 48 | 74 | 21 | 11 | 16 | 57 | 50 | 7 |
| 8 | 栃木 | 48 | 70 | 19 | 13 | 16 | 58 | 49 | 9 |
| 9 | 大分 | 48 | 64 | 15 | 19 | 14 | 48 | 51 | -3 |
| 10 | 熊本 | 48 | 63 | 16 | 15 | 17 | 44 | 58 | -14 |
| 11 | 愛媛 | 48 | 60 | 14 | 18 | 16 | 53 | 59 | -6 |
| 12 | 横浜F | 49 | 59 | 16 | 11 | 22 | 54 | 66 | -12 |
| 13 | 北九州 | 48 | 59 | 16 | 11 | 21 | 47 | 71 | -24 |
| 14 | 岡山 | 49 | 58 | 15 | 13 | 21 | 57 | 78 | -21 |
| 15 | 京都 | 36 | 52 | 15 | 7 | 14 | 45 | 43 | 2 |
| 16 | 水戸 | 49 | 51 | 12 | 15 | 22 | 48 | 64 | -16 |
| 17 | 富山 | 48 | 50 | 13 | 11 | 24 | 47 | 76 | -29 |
| 18 | 湘南 | 36 | 45 | 12 | 9 | 15 | 44 | 44 | 0 |
| 19 | 岐阜 | 48 | 36 | 9 | 9 | 30 | 48 | 93 | -45 |
| 20 | 鳥取 | 36 | 31 | 8 | 7 | 21 | 33 | 53 | -20 |
| 21 | 福岡 | 13 | 26 | 8 | 2 | 3 | 21 | 14 | 7 |
| 22 | 柏 | 12 | 25 | 7 | 4 | 1 | 26 | 8 | 18 |
| 23 | 甲府 | 12 | 21 | 5 | 6 | 1 | 26 | 12 | 14 |
