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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 鳥栖 | 51 | 84 | 23 | 15 | 13 | 77 | 47 | 30 |
| 2 | 徳島 | 50 | 84 | 25 | 9 | 16 | 70 | 48 | 22 |
| 3 | 札幌 | 50 | 81 | 24 | 9 | 17 | 59 | 44 | 15 |
| 4 | 東京V | 50 | 80 | 23 | 11 | 16 | 88 | 57 | 31 |
| 5 | 千葉 | 50 | 77 | 22 | 11 | 17 | 62 | 52 | 10 |
| 6 | 群馬 | 50 | 76 | 22 | 10 | 18 | 61 | 67 | -6 |
| 7 | F東京 | 36 | 74 | 22 | 8 | 6 | 65 | 20 | 45 |
| 8 | 栃木 | 50 | 70 | 19 | 13 | 18 | 59 | 55 | 4 |
| 9 | 熊本 | 50 | 67 | 17 | 16 | 17 | 46 | 59 | -13 |
| 10 | 愛媛 | 50 | 66 | 16 | 18 | 16 | 57 | 61 | -4 |
| 11 | 大分 | 50 | 65 | 15 | 20 | 15 | 52 | 56 | -4 |
| 12 | 横浜F | 50 | 62 | 17 | 11 | 22 | 57 | 68 | -11 |
| 13 | 北九州 | 50 | 59 | 16 | 11 | 23 | 47 | 74 | -27 |
| 14 | 岡山 | 51 | 58 | 15 | 13 | 23 | 58 | 84 | -26 |
| 15 | 水戸 | 51 | 53 | 12 | 17 | 22 | 48 | 64 | -16 |
| 16 | 京都 | 36 | 52 | 15 | 7 | 14 | 45 | 43 | 2 |
| 17 | 富山 | 50 | 50 | 13 | 11 | 26 | 49 | 80 | -31 |
| 18 | 湘南 | 36 | 45 | 12 | 9 | 15 | 44 | 44 | 0 |
| 19 | 岐阜 | 50 | 39 | 10 | 9 | 31 | 49 | 95 | -46 |
| 20 | 福岡 | 15 | 32 | 10 | 2 | 3 | 25 | 16 | 9 |
| 21 | 柏 | 14 | 31 | 9 | 4 | 1 | 30 | 9 | 21 |
| 22 | 鳥取 | 36 | 31 | 8 | 7 | 21 | 33 | 53 | -20 |
| 23 | 甲府 | 14 | 25 | 6 | 7 | 1 | 31 | 16 | 15 |
