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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 札幌 | 41 | 73 | 22 | 7 | 12 | 50 | 30 | 20 |
| 2 | 鳥栖 | 41 | 72 | 20 | 12 | 9 | 62 | 33 | 29 |
| 3 | 徳島 | 41 | 68 | 20 | 8 | 13 | 53 | 38 | 15 |
| 4 | F東京 | 33 | 65 | 19 | 8 | 6 | 56 | 18 | 38 |
| 5 | 東京V | 40 | 61 | 17 | 10 | 13 | 73 | 49 | 24 |
| 6 | 千葉 | 41 | 61 | 17 | 10 | 14 | 49 | 44 | 5 |
| 7 | 群馬 | 41 | 60 | 17 | 9 | 15 | 52 | 57 | -5 |
| 8 | 熊本 | 40 | 59 | 15 | 14 | 11 | 38 | 44 | -6 |
| 9 | 栃木 | 40 | 56 | 15 | 11 | 14 | 47 | 45 | 2 |
| 10 | 大分 | 41 | 55 | 13 | 16 | 12 | 42 | 43 | -1 |
| 11 | 北九州 | 40 | 51 | 14 | 9 | 17 | 39 | 58 | -19 |
| 12 | 愛媛 | 40 | 50 | 12 | 14 | 14 | 44 | 51 | -7 |
| 13 | 岡山 | 41 | 47 | 12 | 11 | 18 | 47 | 66 | -19 |
| 14 | 京都 | 33 | 46 | 13 | 7 | 13 | 41 | 40 | 1 |
| 15 | 富山 | 41 | 46 | 12 | 10 | 19 | 43 | 62 | -19 |
| 16 | 湘南 | 33 | 45 | 12 | 9 | 12 | 40 | 37 | 3 |
| 17 | 横浜F | 41 | 45 | 12 | 9 | 20 | 39 | 54 | -15 |
| 18 | 水戸 | 41 | 42 | 10 | 12 | 19 | 41 | 56 | -15 |
| 19 | 鳥取 | 33 | 31 | 8 | 7 | 18 | 32 | 42 | -10 |
| 20 | 岐阜 | 40 | 25 | 6 | 7 | 27 | 40 | 86 | -46 |
| 21 | 福岡 | 8 | 17 | 5 | 2 | 1 | 14 | 8 | 6 |
| 22 | 柏 | 7 | 15 | 4 | 3 | 0 | 15 | 3 | 12 |
| 23 | 甲府 | 7 | 12 | 3 | 3 | 1 | 15 | 8 | 7 |
