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※延長戦は、PK勝ち・Vゴール=>勝ち点3、引分=>勝ち点1、負け=>勝ち点0で計算しています。
順位表
| 順位 | チーム | 試合数 | 勝点 | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 鳥栖 | 44 | 75 | 21 | 12 | 11 | 65 | 36 | 29 |
| 2 | 札幌 | 43 | 72 | 21 | 9 | 13 | 49 | 36 | 13 |
| 3 | 千葉 | 43 | 70 | 20 | 10 | 13 | 53 | 44 | 9 |
| 4 | 東京V | 43 | 69 | 20 | 9 | 14 | 80 | 51 | 29 |
| 5 | 徳島 | 43 | 68 | 20 | 8 | 15 | 56 | 43 | 13 |
| 6 | 群馬 | 44 | 65 | 19 | 8 | 17 | 53 | 59 | -6 |
| 7 | F東京 | 32 | 64 | 19 | 7 | 6 | 55 | 17 | 38 |
| 8 | 栃木 | 43 | 63 | 17 | 12 | 14 | 51 | 46 | 5 |
| 9 | 熊本 | 43 | 62 | 16 | 14 | 13 | 40 | 47 | -7 |
| 10 | 大分 | 44 | 59 | 14 | 17 | 13 | 44 | 46 | -2 |
| 11 | 愛媛 | 43 | 54 | 13 | 15 | 15 | 46 | 52 | -6 |
| 12 | 横浜F | 44 | 53 | 14 | 11 | 19 | 49 | 58 | -9 |
| 13 | 北九州 | 43 | 49 | 13 | 10 | 20 | 38 | 65 | -27 |
| 14 | 岡山 | 44 | 48 | 12 | 12 | 20 | 49 | 73 | -24 |
| 15 | 湘南 | 32 | 45 | 12 | 9 | 11 | 40 | 36 | 4 |
| 16 | 水戸 | 44 | 44 | 10 | 14 | 20 | 42 | 58 | -16 |
| 17 | 京都 | 32 | 43 | 12 | 7 | 13 | 40 | 40 | 0 |
| 18 | 富山 | 43 | 43 | 11 | 10 | 22 | 40 | 68 | -28 |
| 19 | 岐阜 | 43 | 32 | 8 | 8 | 27 | 40 | 83 | -43 |
| 20 | 鳥取 | 32 | 31 | 8 | 7 | 17 | 30 | 38 | -8 |
| 21 | 福岡 | 12 | 23 | 7 | 2 | 3 | 18 | 13 | 5 |
| 22 | 柏 | 11 | 22 | 6 | 4 | 1 | 23 | 6 | 17 |
| 23 | 甲府 | 11 | 20 | 5 | 5 | 1 | 23 | 9 | 14 |
